荀子在《劝学篇》中讲到,”君子性非异也,善假于物也“。在生活中,善用各种工具能够极大的提高我们的效率,在科研工作中亦是如此。今天给大家介绍在科学研究和论文写作自己常用到的“七种武器”,有了它们,可以让你的科研工作事半功倍~
1、google scholar
做文献调研是一件相当痛苦的事情,因为既要做到“准”,同时又要做到“全”。在常用的文献数据库中逐个去进行检索显然是一件费力不讨好的事情。google scholar 搜索完美的解决了这个问题。
- Google scholar除了收录所有的文献数据库外,还收录了最新的会议论文和预印文本,这对像AI这样发展迅猛的领域而言尤为重要,因为绝大多数的最新成果都不会发表在期刊上。你可以在google上搜索“summay”或者“review”之类的关键字眼,来对某个领域进行最全最新的调研。
- google scholar 记录了某篇的文献的引用,这极大地方便了我们对一些思路进行追根溯源。
- 可以运用邮件的方式跟踪某个关键词的搜索结果,保证随时跟踪某仿麦呢的最新成果。
- google scholar还支持endnote等文献管理软件格式的导出。
2、文献管理类工具
要想写出好论文,首先得有好的idea。好的idea在很大程度上取决于你阅读量多少高质量的论文。这时如何管理这些数量庞大的文献就成了一个棘手的问题。在这里我给大家推荐endnote文献管理软件。它支持文献的批量导入、分组、星标、笔记、pdf预览等功能。我自己的应用场景是这样的:
- 在计算机科学领域,最新最好的论文一般出现在最新的会议上面,对于这些论文,自己一般会做到全部阅读。从网上下载好论文集之后,导入endnote软件,然后简单的浏览标题,并按照重要性进行星标,在所有的论文都浏览完之后,对重要性进行排序,然后有重点的阅读这些文献,在阅读的过程中可以做笔记然后进行分类。
- 在google上做文献调研的时候,会批量的以endnote格式下载很多论文,然后按照上面的方式进行整理。
- 在期刊上看到比较好的文章,直接利用endnote的全文检索功能进行下载
- endnote很好的支持同步和分享功能。
- 此外,如果是在world中写论文,会利用endnote的来插入参考文献。
有了以上的一些使用,只要坚持下去,就可以把endnote打造成了一个庞大的论文库,以后想看什么论文,或者是论文写作时,直接在这里进行查阅,或者分享给他人,非常的方便。
3、笔记类工具
“好记性不如烂笔头”,在阅读大量文献的过程中,你需要做一些笔记,包括自己的看法、疑惑和灵感。最好的办法当然是把这些东西记录在电子类笔记上,这里我推荐为知笔记,自己也是该产品的深度用户。为知笔记像大多数其他笔记类工具,如印象笔记和有道云笔记一样,支持多终端同步、mardown笔记、笔记分类与标签等主要功能。自己的使用场景如下:
- 把精读过的文章分门别类的放在自己创建的目录下面,对于每篇文献,会用markdown做一些简单的记录,文献的pdf文件会以附件的形式存放在笔记里面,最后还会给笔记添加一些标签,包括这篇文章创新点、解决的问题和值得借鉴的地方等。
- 平时如果你有什么好的灵感,会在手机进端进行记录。
和endnote一样,久而久之,我们会把为知笔记打造成一个论文的灵感库。以后可以随时随地方便地查看,如果有某个想法不记得,还可以运用搜索功能进行搜索。
4、思维导图
说起思维导图,很多人不以为意,其实这是一款被很多人远远低估的工具。大部人拿思维导图来做笔记,而且花费大量的时间来使脑图做的更加漂亮,这有些本末倒置。本质上,思维导图是一个帮助我们思考的工具。我们的大脑就像一台电脑,内存有限,不可能同时容纳很多问题并进行思考,这是就需要一块"外接内存"——思维导图,来帮助我们进行思考。在这里推荐两款思维导图的工具
- 白纸+铅笔
我喜欢用铅笔在一张白纸上来画思维导图。先头脑风暴写下所有的想法,然后认真思考这些想法的关系,对想法进行合并或者删除,最后剩下的一些东西,便是最重要的的东西。通过这个先发散后抽象的思维过程,我们能够思考清楚多问题。所以真正的思维导图应该是杂乱无章的,反映了思维的过程。
2. the Brain
有很多人可能习惯使用思维导图软件,在这里推荐the brain。目前市场上几乎所有的思维导图软件都不能展现出思维的这种网络结构,它们一般只能够表达树状的拓扑结构。the brain最大特点是多中心节点,一个节点不仅有子节点和父节点,还有一个跳跃(jump)的节点,这样这个脑图就完全能够模拟人思维过程。如果有一个时间跨度比较大的项目,我会运用the Brain做思维导图,因为易于保存;一般情况下,我还是习惯在纸上进行绘制,酣畅淋漓的感觉使得思维更加的流畅。
5、Adobe Illustrator(AI)
一篇好的论文包括精美的示意图。一般论文作图使用Microsoft Visio或者Adobe Illustrator。AI较前者的最大优势在于它绘制出的全部是矢量图。矢量图最大的特点就是和分辨率无关,无论怎们放缩,都不会失真。Adobe Illustrator的安装较复杂,而且软件也较大,不方便或者不喜欢的朋友可以使用网页版的AI。登陆https://uzer.me/ 选择AI应用,网页端的体验感也相当的好。下面是我用AI做出的流程图
6、图表绘制工具
漂亮的图表和流程图一样不可或缺,他使你的论文更加有说服力。这里我推荐matplotlib。它是python绘图包中应用最广泛、功能最强大的工具包,很多其他可视化包都是在matplotlib的基础上进行开发的。掌握了它,基本上能够会出所有你想绘制的图标。进入matplotlib官网的gallery,你可以看到很多的examples,想要画什么样的图,就直接找到相应的示例,然后复制代码进行调整即可。
7、overleaf
最后介绍一款云端的latex编辑工具。overleaf能够帮助你省去很多的latex配置时间,而且它还支持实时的编译和预览以及期刊投稿。
作者:Ryan
链接:https://www.zhihu.com/question/27349043/answer/2455387834
来源:知乎
著作权归作者所有。商业转载请联系作者获得授权,非商业转载请注明出处。
工欲善其事,必先利其器。有了称手好用的工具,做调研查资料也会快人一步。接下来分享一下自己在用的一些网站和工具,希望能给大家作为参考。主要是计算机和深度学习相关的。
文献检索
- 谷歌学术:scholar.google.com 最知名的学术搜索引擎。
- 论文搜索:www.semanticscholar.org 是我用的第二多的搜索引擎,查关联很好用。
- 微软学术:academic.microsoft.com 可以作为参考。
- Aminer: Aminer.com 一个国内的文献检索网站,也有很多小工具。
- 在线阅读:Readpaper.com 也是国内的一个一站式文献检索和阅读网站。
- 引用查询:https://citeseerx.ist.psu.edu crossref.org/
文献分析
- 论文分析:paperdigest.org 没有其他文献搜索引擎那么有名,但是也有些好用的小工具,比如会议论文列表CVPR 2021。
- 引用关系: connectedpapers.com 可以用图结构表示论文间引用关系。
- 文献管理:mendeley.com 是Elsevier旗下的免费文献管理软件,有云同步,自动解析等等功能,全平台覆盖,还是比较方便的。
- 文献翻译:https://www.zhiyunwenxian.cn 知云应该是挺出名的,而且是免费的
文献下载
文献下载 会议文章大多都是开放下载的,github上也会有很多相关的资源。如果在学校里一般都有Springer、IEEE Xplore和ACM Digital Library的下载权限。
- 预印本网站:arxiv.org 人工智能相关论文大多都会先挂在arxiv上。
- 开放评审:openreview.net 有些会议或者Workshop会上Openreview。
- 论文下载:scihub 懂的都懂
- 书籍下载:libgensis 懂的都懂
文献相关
文献推荐主要是来自一些公众号,比如CVer,arxivdaily之类的,不过也有专门的软件可以平时刷一刷。最简单的可以在知乎,Github,Twitter等等社交平台活捉一些大佬,然后关注他们的进展。
- 学者标识:orcid.org 学者的唯一标识码,也可以在这里展示文章。
- 学校排名:csrankings.org 可以按学校、方向查询研究者。
- 人物数据库:dblp.org 和google scholar的个人页面差不多,能看到所有关联论文。
- 会议排名:guide2research.com 可以方便显示会议排名和提交时间,也有很多其他科研信息。
- Researcher:https://www.researcher-app.com 主要是一些期刊的推荐
- ResearchGate:https://www.researchgate.net 老牌的科研社交社区
代码相关
深度学习领域比较崇尚开源,无论是论文还是代码模型数据集都很多免费的资源,数据集一般都有版权(Copyright)或者协议(License)约束,建议直接去作者的项目网站下载。
- 数据集搜索:datasetsearch.research.google.com 谷歌新推出的搜索引擎,能快速定位数据集网站。
- Github: Github 永远嘀神。
- 数据集平台:kaggle.com 打比赛的网站,也有很多数据集。
- 代码搜索:paperswithcode.com 查SOTA,查任务,查实现。
- 数据作图:https://matplotlib.org https://texample.net/tikz/examples/ matpoltlib应该是标配了,tikz可以直接再latex里画图,不担心缩放
深度学习
以下列一些深度学习生态里面相关的工具,如果不做深度学习可以跳过这部分。
- 代码框架:https://www.pytorchlightning.ai 方便快速构建
- 分布式和调参:https://ray.io/ 一站式的大规模模型训练框架
- 向量变换:https://github.com/arogozhnikov/einops Transformer相关
- 训练可视化:visdomWeights & Biasestensorboard 各有各的优点,visdom轻量,wandb云存储,tensorboard全面
- Colab:colab.research.google.com 可以直接运行一些Github模型,也能做些小实验。
- 混合精度:GitHub - NVIDIA/apex: A PyTorch Extension: Tools for easy mixed precision and distributed training in Pytorch 英伟达提出的混合精度训练工具
- Numpy加速:A High Performance Python Compiler
写作相关
- 论文写作:overleaf.com 大概是写论文默认软件了。
- 术语搜索:wolframalpha.com 有很多小工具和小知识点。
- 绘图软件:draw.io 可以方便画很多流程图和结构图,可导出svg和pdf。
- 中英术语:Artificial-Intelligence-Terminology-Database 术语英译中。
- 表格生成:https://www.tablesgenerator.com/ 不会画Latex表格的话那就直接一键生成吧
- 公式OCR:https://www.latexlive.com 相较于收费的MathPix,这个网站是免费的
- 谷歌翻译:google translate 一定会用得上的
- 语法修改:languagetool 相较于收费的Grammarly这个可以满足基本需求,配合overleaf很好用
- 格式转换:Pandoc 可以将latex转换为你想要的任何格式
对于研究人员来说,寻找合适的期刊来发表自己的学术成果是至关重要的。如果选择了与论文内容并不匹配的期刊进行投稿,很有可能面临的就是被拒稿的结局。为了解决这一问题,这里列出了几款有用的在线工具,帮助正需要投稿的同学推荐合适的期刊。
Journal Finder搜索工具由Elsevier公司开发,提供引擎支持,使用智能搜索技术和专业研究领域的特定词汇来匹配你需要发表的文章,可以帮助科研人员筛选出最适合发表的科研期刊。下面文章中有对其更为详细的介绍。
EditSprings学术编辑:SCI论文发表:帮助筛选投稿期刊的工具12 赞同 · 0 评论文章正在上传…重新上传取消
2. IEEE Publication Recommender
此网站能够搜索170+种学术期刊和1500+种学术会议。通过比较一些关键要素,例如影响因子和提交到发布的时间,一键为您提供关键数据。
Journal Suggester运用的是基于互联网的语义搜索技术,操作简单,用户只需要提供待投稿的论文摘要就能够开始系统匹配工作,可以从搜寻到的期刊列表里选择与其论文匹配度最高的期刊。索引结果从Springer旗下超过2,600种期刊中产生,匹配结果快速准确。
4. Journal Article Name Estimator (JANE)
该网站仅限于包含在Medline数据库中的期刊,其数据库由美国国家医学图书馆出版。因此,它仅限于生物医学科学期刊。该网站提供了一种代替输入文章标题和摘要的搜索方法——可以在搜索框中输入关键字来寻找合适的期刊。
该网站不需要提供文章的相关内容,可以通过杂志的主题领域、是否允许公开访问等因素搜索。覆盖范围广,能够根据需要的因素查找合适的期刊。
Journal Guide是一款免费工具,由一群软件开发人员、前研究人员和研究广场的学术出版老手创建。可以采用四种检索模式:文章匹配,期刊名称,出版商,分类。涵盖所有学术领域的不断发展的期刊数据库,能够搜索,过滤,排序和比较来自46,000多种期刊的期刊。
总之,熟悉您所在领域的论文期刊的最佳方法是:
1. 阅读所在研究领域中的优秀文章,并留意其发表期刊。
2. 结合多种筛选工具比对筛选结果,据此选择。
3. 咨询导师或研究领域的专家,请其推荐。
作者:tate
链接:https://www.zhihu.com/question/27349043/answer/886301814
来源:知乎
著作权归作者所有。商业转载请联系作者获得授权,非商业转载请注明出处。
1. 文献管理——zotero
https://www.zotero.org/www.zotero.org/
在使用Zotero之前,我经常使用的文献管理软件是Endnote和CNKI-estudy,CNKI对于中文支持比较好,Endnote对于英文文献支持较好,对于中文文献支持较差,在使用这两个软件的过程中,我发现这两个软件存在以下问题:
1)软件启动速度慢
2)不能同时较好的支持中英文
3)收费
直到遇到Zotero软件,对于文献管理终于达到了最优解,Zotero除了能够完美解决上述两个文献管理软件的缺点,还具备以下优点:
1)与坚果云软件配合使用,上传更新速度基本达到秒更新;
2)与apple store中的Papership软件配合使用能够实现文献在多平台的同步;
注:意思就是可以在ipad上看文献,所有的修改可以快速的同步到电脑端,我看东西的时候喜欢涂涂画画以提高我的专注度,为了实现这个功能特意花重金买了一款ipad air3和一只一代的apple pencil;
3)配合浏览器中的zotero connector插件可以实现中国知网、爱斯维尔、谷歌学术等诸多论文下载渠道的论文抓取;
Zotero的功能众多,此处不赘述,具体可以看下面这位大神的教程
青柠学术:Zotero | 打造最佳文献生态(入门篇)247 赞同 · 25 评论文章正在上传…重新上传取消
2.英文论文修改 ——grammarly
Write your best with Grammarly.app.grammarly.com/正在上传…重新上传取消
Grammarly是一款在线语法纠正和校对工具,支持Windows、Mac、iOS和Android等多个平台。它能够检查单词拼写、纠正标点符号、修正语法错误、调整语气以及给出风格建议等;对学术写作来说,Grammarly还可以帮助查重。
在平时的论文写作中,难免出现拼写及一些语法错误,使用Grammarly能够有效的避免一些低级错误。
3.中文材料校对——秘塔写作猫
秘塔写作猫www.xiezuocat.com/#/正在上传…重新上传取消
前段时间写一个两万多子的材料,当时写的比较着急,没有太充分的时间进行仔细的校对,但是又怕出现错别字等低级错误,于是在网上查询是否有类似与Grammarly的中文材料校对软件。于是找到了秘塔写作猫这一中文校对神器,秘塔写作猫目前是一个网站,界面与Grammarly类似。
![](https://i-blog.csdnimg.cn/blog_migrate/d89c4e446c7c9d2922ee21cf750f2da3.jpeg)
网站示例
4.云盘软件——坚果云
使用坚果云是由于Zotero的云存储空间只有300M,压根放不了几篇文章,而Zotero可以与坚果云关联进而达到拓展云盘存储的目的。坚果云的作用还不仅限于此,坚果云还可以实现多人协同,具体场景可以是三四个人写综述、材料等,具体配置方法如下:
tate:坚果云 | 一起愉快的论文协作吧!13 赞同 · 6 评论文章正在上传…重新上传取消
5.数据绘图软件——Origin
在学会origin以前,我比较常用的作图软件是Matlab和Python里面的matplotlib库,使用这两个软件作图总有一种用高射炮打蚊子的感觉,做个简单的折线图需要等待Matlab龟速一般的启动速度令我抓狂,使用Python作图改动、调整起来难度比较大。在机缘巧合下,我得知origin软件可以免费支持大学生使用,立刻马上的投入了origin的怀抱!高校研究生可以通过校园邮箱使用Origin正版软件,具体步骤如下:
tate:软件安装 | 高校edu邮箱免费使用正版origin软件260 赞同 · 151 评论文章正在上传…重新上传取消
6.文献阅读——知云文献翻译
正如知云文献官网介绍的,,知云文献翻译是目前最适合中国科研人员阅读英文文献的软件(没有之一),详细介绍如下:
知云文献翻译怎么样?弱弱滴问一句,存不存在欺骗或剽窃行为?660 赞同 · 101 评论回答正在上传…重新上传取消
作者:张一柯
链接:https://www.zhihu.com/question/27349043/answer/1648074923
来源:知乎
著作权归作者所有。商业转载请联系作者获得授权,非商业转载请注明出处。
科研软件那么多,对于科研新手来讲平时找文献、作图还是学习找资料都困难重重。在此我推荐一些实用软件给大家。涉及到科研工作的方方面面,基本可以满足科研新手的需求了。
按照惯例,还是先上一张思维导图
文献管理
文献查找
这一部分可以参考我的这个回答:
中文网站推荐:
1、中国知网
上榜理由:对于英文不好的同学大部分知网上的硕博论文可以帮助你快速了解这个领域
2、百度学术
上榜理由:主要用于文献查找,查找到文献后可以去sic-hub上进行下载
3-7:sci-hub到龙猫学术导航
上榜理由:就是好用,主推sci-hub和谷粉学术
文献翻译
8、知云文献翻译
上榜理由:傻瓜式操作,翻译引擎可以选择谷歌生物医学专业翻译
9、CopyTranslator
上榜理由:CopyTranslator官方版是一款十分出色的翻译工具。CopyTranslator官方版界面美观大方,功能强劲实用,支持几十种不同语言的互译,支持对多段文字进行快速的翻译,使用起来简单便捷。CopyTranslator还有丰富的选项可以设置,有效提高人们阅读及翻译外文文献的效率。准确是它最nice的地方
文献管理
10、EndNote
上榜理由:直接从网络搜索相关文献并导入到Endnote的文献库内;收藏,管理和搜索个人文献和图片、表格;直接在Word中格式化引文和图形,利用文稿模板直接书写合乎杂志社要求的文章;可以自动帮助我们编辑参考文献的格式
笔记工具
11、有道云笔记
上榜理由:分类整理笔记,高效管理个人知识,快速搜索,分类查找,安全备份云端笔记,存储永不丢失的珍贵资料
学习工具
电子书
14、鸠摩搜索
上榜理由:你想要的电子书只要网上有的,基本它能够帮你找到。这个的功能超级强大
视频
15-16:B站、youtube
上榜理由:follow那些知识博主,学习突然变得容易了起来。如果你的英语比较好,你会发现油管上优质的视频相对的多
生信项目
17、github
上榜理由:follow大神的开源项目,你的编程知识将与日俱进
18、实验楼
上榜理由:提供编译环境,简单容易操作,适合新手
19、biostar
上榜理由:如果你有生信相关的问题可以尝试上这个网站看看有没有解决方案,可能其他人也已经遇到你的问题了呢。
20、rosalind
上榜理由:一个专注于生信人的编程网站,称为学徒开始练习吧
分析工具
21、Spss
上榜理由:SPSS为IBM公司推出的一系列用于统计学分析运算、数据挖掘、预测分析和决策支持任务的软件产品及相关服务的总称。
22、Stata
上榜理由:SPSS为IBM公司推出的一系列用于统计学分析运算、数据挖掘、预测分析和决策支持任务的软件产品及相关服务的总称
23-24:R、Python
R推荐使用Rstudio,python推荐使用pycharm或者直接用anaconda
按照教程:Anaconda安装使用避坑指南
上榜理由:R是由统计学专家编写的,所以在数值分析上具有先天的优势,pthyon的库为你提供了丰富分析的工具,例如:panda库
图片处理
绘图、拼图、截图、改图
25、Snipaste
上榜理由:科研截图专用,清晰度保证
26、PS
上榜理由:神器,与图片相关的都可以找它。如果只需要用一些简单的功能,用在线PS也ok
27、ppt
上榜理由:office办公软件系列真的是无所不能,很多数据分析大神一开始都是用excel做分析
备注:office和PS的软件可私信我发给你~
思维导图和流程图
锻炼结构性思维做思维导图是很有用的
28-29:幕布、Xmind
上榜理由:帮你用更高效的方式和更清晰的结构来记录笔记、管理任务、制定计划,幕布可以直接在线做,会经常免费送会员。
30、process on
上榜理由:如果你需要画流程图,它可以帮你一把
项目管理
31、滴答清单
上榜理由:实际工作或者科研项目中通常需要进行过程管理,滴答清单是一个不错的选择。及时查看自己的任务。
小工具
32、PDFXEdit
上榜理由:如果你想复制pdf的文字或者去水印,它会给你安全感
33、超级pdf
上榜理由:你想转什么格式就转什么格式