【SimpleITK】坐标次序问题

读取一个nii.gz文件:

import SimpleITK as sitk
data_path = 'example.nii.gz'
data_1 = sitk.ReadImage(data_path)

查看对象的大小size:

data_1.GetSize()

(320, 260, 72)
三个值分别如何对应呢?

查看对象的Depth,Height, Width:

data_1.GetWidth(), data_1.GetHeight(), data_1.GetDepth()

(320, 260, 72)

在这里插入图片描述

从对象中读取numpy数组,查看numpy大小

arr_1 = sitk.GetArrayFromImage(data_1)
arr_1.shape

(72, 260, 320)
在这里插入图片描述

在sitk对象中,GetSize()得到的是:[x, y, z] —> [width, height, depth]
而numpy中,shape为:[z, y, x] —> [depth, heitht, width]。

从arr中读取一个slice并显示:

plt.imshow(arr_1[36,:,:], cmap = 'gray')

在这里插入图片描述

  • 5
    点赞
  • 9
    收藏
    觉得还不错? 一键收藏
  • 0
    评论
评论
添加红包

请填写红包祝福语或标题

红包个数最小为10个

红包金额最低5元

当前余额3.43前往充值 >
需支付:10.00
成就一亿技术人!
领取后你会自动成为博主和红包主的粉丝 规则
hope_wisdom
发出的红包
实付
使用余额支付
点击重新获取
扫码支付
钱包余额 0

抵扣说明:

1.余额是钱包充值的虚拟货币,按照1:1的比例进行支付金额的抵扣。
2.余额无法直接购买下载,可以购买VIP、付费专栏及课程。

余额充值