安装环境:ubuntu18.04
安装包版本:fsl-6.0.3
一、安装包
安装包下载地址:http://fsl.fmrib.ox.ac.uk/fsldownloads/fsl-6.0.3-centos7_64.tar.gz
下载之后拷贝到ubuntu中,并解压出来
下载软件:可以拷贝上述链接到迅雷中下载,文件大小为3.5G左右
二、配置环境变量
在/home/username/.bashrc下配置环境变量
FSLDIR=/home/username/fsl
. ${FSLDIR}/etc/fslconf/fsl.sh
PATH=${FSLDIR}/bin:${PATH}
export FSLDIR PATH
注意将中间的FSLDIR替换为自己的安装路径
之后重新打开一个terminal,输入fsl,就能打开fsl GUI,但是会发现点击fsleyes失效。
三、修复fsleyes not found的问题
在terminal中输入
curl -o miniconda_installer.sh -L --fail https://repo.continuum.io/miniconda/Miniconda3-latest-Linux-x86_64.sh
echo $?
md5 miniconda_installer.sh
之后
cd $FSLDIR/etc/fslconf
sudo gedit fslpython_install.sh
修改第149行