22.12.2GeMoMa进行同源预测操作记录

#创建GeMoMa conda环境

conda create -n GEMOMA -c bioconda gemoma
conda activate GEMOMA

#运行GeMoMa

GeMoMa GeMoMaPipeline threads=10 outdir='pwd' GeMoMa.Score=ReAlign AnnotationFinalizer.r=NO o=true t=[target.fasta] a=[reference.gff] g=[reference.fasta] -Xms5G -Xmx50G

#合并多个参考基因组生成的gff文件

GeMoMa GAF g=[gff] w=[weight] outdir
#g= w= 可以多次使用

参考

gemoma安装与简单用法 - 简书

基因注释工具GeMoMa - 简书

GeMoMa - Jstacs