minimus2安装
「基因组组装」用AMOS/minimus2合并两个contig-CSDN博客
conda create -n minimus2
conda search amos
conda install amos=3.1.0
minimus2 -h
源码安装太复杂了,还好conda能安啊
conda的minimus2的文件夹,里面bin里面的minimus2,打开修改一下这两个地方,否则会报错
#第一步合并序列
cat 1.fasta 2.fasta 3.fasta > 123.fasta
#第二部转换格式
toAmos -s 123.fasta -o 123.afg
#第三步调用minimus2
minimus2 123 -D REFCOUNT=0