signalP6.0本地化安装与使用

最新推荐文章于 2025-03-25 14:43:04 发布

CAAS_IFR_zp

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文章标签： python

本文链接：https://blog.csdn.net/m0_53945548/article/details/129395977

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文章讲述了下载SignalP6.0进行本地化安装的便利性，以避免在线处理大量文件的不便。作者在下载fast模式的版本后，按照流程进行Python安装，但在运行时遇到了与CUDA相关的错误，具体表现为无法打开libcublas.so.11库文件。尽管尝试解决但未成功，计划次日继续处理。

摘要生成于 C知道，由 DeepSeek-R1 满血版支持，前往体验 >

今天来下载本地化的signalP6.0

在线网址如下（也挺好用的）：SignalP 6.0 - DTU Health Tech - Bioinformatic Services

还是很方便的

本地化主要是处理服务器上很多文件的时候，一个个在线提交太麻烦了，就直接在服务器预测吧！

在刚刚的官网点击Downloads，有fast和slow模式，主要是得到的结果不一样吧，这里选择fast

填写名字，机构，邮箱等信息，阅读许可之后，可以获得一个邮件

下载下来（还挺大的）

tar -xzvf signalp-6.0g.fast.tar.gz
#进入解压好的文件夹
python setup.py install
#看到Finished processing dependencies for signalp6==6.0+g
signalp6 --help
#报错了。。

报错了，可能是cuda的问题

OSError: /home/microbelab/miniconda3/lib/python3.9/site-packages/nvidia_cuda_runtime_cu11-11.7.99-py3.9-linux-x86_64.egg/nvidia/cublas/lib/libcublas.so.11: cannot open shared object file: No such file or directory

搞半天没搞出来，明天再试试。。。

确定要放弃本次机会？

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