Ubuntu： 自留小技巧

#!/bin/bash

# 指定要检查的文件夹
folder="/path/to/your/directory"

# 遍历文件夹中的每一个文件
for file in "$folder"/*
do
    # 检查文件中的每一行是否都包含"#"
    if awk '!/#/' "$file" | read -r _
    then
        # 如果有一行不包含"#"，则跳过这个文件
        continue
    else
        # 如果所有行都包含"#"，则删除这个文件
        rm "$file"
    fi
done

 如果所有行都包含"#"，则删除这个文件

ubuntu小技巧自己留(不定时更新)-CSDN博客

输出fasta文件>序列名字到一个txt文件

grep ">" fasta_file > output_file

将fasta序列名第一个空格之后的内容去掉

>AB000403.1_1 # 104 # 679 # 1 # ID=1_1;partial=00;start_type=ATG;rbs_motif=None;rbs_spacer=None;gc_cont=0.405
到

>AB000403.1_1

awk '{print $1}' your_fasta_file.fasta > new_fasta_file.fasta

对一个txt文件处理，如果一行里面有“某个”字符串，删除这一行 

grep -v "unknown" file.txt > newfile.txt

ubuntu删除空的文件

find . -type f -size 0c | xargs -n 1 rm -f

md5查看文件完整性

md5sum filename