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本文档详细介绍了如何使用R包spatialCNV进行空间拷贝数变异（CNV）分析，包括从Loupe Browser导出注释、导入注释和表达矩阵、合并数据、运行inferCNV以及结果分析。内容涵盖每个步骤的关键操作和参数设置，旨在帮助生物信息学者理解和应用该工具。
R包地址https://github.com/aerickso/SpatialInferCNV
官方说明文档：https://aerickso.github.io/SpatialInferCNV/
文章Spatially resolved clonal copy number alterations in benign and malignant tissue发在nature
安装不难就不再赘述 服务器可以成功配置
第一步：Preparation of example histological annotations in the Loupe Browser
这一步使用Loupe软件，将感兴趣的区域在软件中标注，并且命名。示例中选择新建的类别是'Histology'，在Cluster中进一步命名圈选区域为“Userguide_12”，自己命名可以命名为“tumor
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