基础函数
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想学习python和R的医学生
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Seurat找到差异基因后 筛选Top10的基因
通常情况下,我们按照logfc从大到小筛选每个cluster的top10差异基因deg1就是findallmarkers的输出结果,改成自己的就好原创 2023-05-27 15:40:30 · 2098 阅读 · 0 评论 -
sub和gsub函数的区别学习
从上面的输出结果可以看出,sub()和gsub()的区别在于,前者只替换第一次匹配的字符串,而后者会替换掉所有匹配的字符串。与之相似的还有grep函数,但grep函数返回的是下标位置。原创 2023-04-09 16:13:45 · 195 阅读 · 0 评论 -
by函数的使用
函数用于将data中的数据,按照INDICES里面的内容拆分成若干个小的data。返回值为list,list内有多个个dataframe 这里会同时执行排序函数。原创 2023-03-30 23:21:29 · 245 阅读 · 0 评论 -
学习一个基础函数 separate()以及他的朋友们
tidyr 的 separate函数分割列原创 2023-03-27 22:34:27 · 760 阅读 · 0 评论 -
踩坑实录二:filter函数的特殊使用
也算学习一下filter函数了原创 2023-03-22 22:23:52 · 235 阅读 · 3 评论 -
R语言file.path()函数的使用与比较;文件名组织方式
file.path函数原创 2023-03-03 16:20:16 · 3345 阅读 · 0 评论 -
记录两个我很喜欢的细胞群命名方法
比一个一个命名要清晰很多。原创 2023-02-28 21:24:11 · 990 阅读 · 1 评论 -
str_split函数的simplify参数与unlist函数的区别
前者把list结果输出为一个矩阵,而后者把所有的结果输出在一个向量里面。两个函数可以使得str_split的结果不为list。原创 2022-12-13 18:55:16 · 294 阅读 · 0 评论 -
R语言中读取和处理文件的常用方法
R语言中查看文件中内容的几个函数,可以用来批量读取文件原创 2022-12-11 11:39:22 · 2397 阅读 · 0 评论 -
踩坑实录一:GEO单细胞样本读取和增加样本metadata信息
两个踩坑:1.读取单细胞数据2.merge病人临床信息原创 2022-11-27 20:31:15 · 8241 阅读 · 1 评论 -
R语言中一个处理变量名中空格横杠的小技巧make.names()
R语言中一个处理变量名中空格横杠的小技巧make.names()原创 2022-11-06 11:08:37 · 1664 阅读 · 0 评论 -
R语言中给数据框增加分组/根据样本名称添加分组的代码
R语言给样本添加分组信息原创 2022-07-27 15:22:38 · 11016 阅读 · 4 评论