查找文献中基因名称对应的基因号

已于 2024-04-15 15:05:30 修改
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分类专栏： 分子生物学 文章标签： 学习
于 2024-04-15 15:03:41 首次发布
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有些文献中只有基因名称并未说明基因号，所以无法直接获得基因序列及基因信息，可以根据一下步骤找到对应的基因序列。

（1）一般在补充材料中有相关基因的定量引物或构建载体所使用的引物序列，在NCBI网站中进行Primer-BLAST；

 

（2）将正反引物序列输入引物框，扩增产物最长长度填写10000（一般基因CDS不会这么长） ，在物种里面选择对应的物种，然后BLAST； 

（3）运行结束后便可得到对应的基因号，并下载对应的基因序列进行验证；

m0_61966818
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基因名文件查序列 linux,已知基因序列，如何查基因名（包括中文名称）
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ImageJ批量将大图分割为多个小图并分别保存
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有时候我们拍摄的图片太大了，想要把图片分割为多个标准的小图，便于观察。使用ImageJ的Process->Batch->Macro批处理方法即可做到，您只需要在Input一栏填入您的原始图像所在路径，Output一栏空着就行，然后在代码框中填入以下代码（您仅需修改最上面的五行参数即可），点击process即可一键完成。.............................................
根据基因名称查看基因详细信息的网址
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05-20 829
首推： https://www.genecards.org/ 其次： https://asia.ensembl.org/index.html
通过基因ID从GFF文件中获取基因位置
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如果对整个数据的查看，就会发现位置不是唯一性的，里面很多同一个位置对应好几个MIM number或者好几个Entrez Gene ID，可能是这个位置太长了，里面对应的基因太多，所以如果我们简单的进行位置转化，在注释的时候，根据位置匹配，就会出现多个基因，最好的是根据OMIM数据库给的提示操作，把对应的位置范围缩小，才能更精准）由于OMIM上的位置是参考基因组GRch38，所以在进行hg19版本的annovar注释时，需要转化为hg19的，根据OMIM数据库上的提示，我们可以从gff文件中获取对应的位置。
查询和保存基因序列
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常见4种基因ID如何区别？如何转换？
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水稻基因命名
GRC
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ncbi查找目的基因序列_如何查找目标基因序列？掌握这几招就够了！（NCBI篇）...
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在创作论文的时候，不知道同学们因为什么而烦恼呢？ 我会因为论文的数据和论文的文件而烦恼。因为论文的数据关乎着我能否完成这个课题的研究，而文献资料也是我完成这篇论文的辅助之一。 但是，我的烦恼也仅限于我找不到相关的文献资料。不过，就在前几天有位同学问我要怎么才能找到外文文献对应的中文文献？
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