原标题:干货 | 如何查找目标基因序列?掌握这几招就够了!(NCBI篇)
上周的干货软文为您介绍了如何在Ensembl数据库查找目标基因序列(Ensembl篇),这周我们将进入NCBI篇,为您讲解如何在该数据库查找目标基因序列。
搜索已被RefSeq收录的基因序列
NCBI,是美国国立生物技术信息中心(National Center for Biotechnology Information)的英文缩写。与专攻基因组检索的Ensembl不同,NCBI数据库的内容更加庞杂和全面,它可提供36种数据检索与分析工具,这其中就包含大家都非常熟悉的文献数据库PubMed。而我们利用NCBI查找目标序列,主要是基于它的RefSeq、即参考序列数据库(reference sequence database)来实现的。概括地说,就是利用相对易获取、或已知的信息,如基因名或基因ID,关联到与之对应的RefSeq序列接收号,从而get目标序列信息。具体操作步骤如下:
01、进入NCBI网站:
进入https://www.ncbi.nlm.nih.gov/,在左侧下拉菜单选择“gene”
02、搜索基因:
可输入基因ID(NCBI Gene ID即GI号)或基因名进行查找。这里以小鼠的隐花色素基因举例,我们直接输入cryptochrome进行搜索,结果如下:
03、找到目标基因:
小鼠Cry1,即第一个结果,点击查看: