本文介绍了在NCBI中查询获取目的基因序列的三种方法：1) 直接在核酸或蛋白数据库中搜索；2) 借助基因组注释文件在全基因组序列中获取；3) 通过blast查找。以巨大芽胞杆菌的PHA相关基因为例，详细阐述了每种方法的操作步骤，并提供了相关文件下载和关键词搜索技巧。
几种在NCBI中查询获取目的基因序列的方法
在NCBI中，如何查询并下载获得某物种的某特定功能的基因序列，相信对于看到此篇的大部分同学来说都不陌生了。想到对于刚开始接触生信的同学们来说，也许尚不能很熟练地在NCBI中查询想要的基因序列，因此在这里简要作了一个总结，希望对初学生信的同学们有所帮助。
此篇博文源于此前有同学问我，提到他导师给他布置任务，查找相关的文献，看相关文献中都报道了哪些细菌物种能够产生聚羟基脂肪酸酯（polyhydroxyalkanoate ，PHA），参与合成该产物的基因都有哪些，然后在NCBI中搜索这些物种的与PHA合成相关的基因序列并比较同源序列间的进化关系。
于是当时给同学整理了一些方法以供参考，今天突然想到，就把之前做的总结修改了一下，在此处与大家分享。以下示例就展示如何在NCBI中查询得到巨大芽胞杆菌（Bacillus megaterium）这个物种中与聚羟基脂肪酸酯（polyhydroxyalkanoate ，PHA）合成相关的基因。
此处共介绍3种方法：
（1）在NCBI的核酸（或蛋白）数据库中查询；
（2）借助基因组注释文件，在全基因组序列中获得（包含两种方式
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