question:
有如下氨基酸序列信息 FERTKPHVNVGTIGHVDHGKTTLTAAITTVLAKTYGITINTSHVEYDTPTRHYAHVDCPGHADYVKNMITGAAQMDGAILVVAATDGPMWEAKILELAGFLDSYIP。每11个氨基酸提取序列,构成一个有意义的片段,每次向后滑动一个氨基酸,屏幕输出格式如下:
1:F 2:E 3:R 4:T 5:K 6:P 7:H 8:V 9:N 10:V 11:G
1:E 2:R 3:T 4:K 5:P 6:H 7:V 8:N 9:V 10:G 11:T
1:R 2:T 3:K 4:P 5:H 6:V 7:N 8:V 9:G 10:T 11:I
... ... ...
直至序列结束
答:
对于这个问题我用python进行操作,滑动窗口是生信分析常用的代码编写
aminoacid = 'FERTKPHVNVGTIGHVDHGKTTLTAAITTVLAKTYGITINTSHVEYDTPTRHYAHVD