vmd分析密度的插件 Density Profile Tool的安装与使用

本文详细介绍了如何安装和使用VMD的Density Profile Tool插件。首先找到VMD的安装目录,然后将densityprofile1.1文件夹复制到plugins/noarch/tcl目录下,接着将density_profile_init.tcl文件移动到scripts/init.d文件夹(如果不存在则创建)。重启VMD后,即可使用该插件进行密度分析。插件的原子选择语法与VMD通用,功能强大。
摘要由CSDN通过智能技术生成

1.找你的VMD软件的安装目录,不确定的话可以使用vmd命令行工具查找。
点击Extenions-TK-console,如下图,输入:puts $env(VMDDIR)
在这里插入图片描述
2.把desityprofile1.1文件夹拷贝到上述路径下的/plugins/noarch/tcl.比如我的是D:/InstallList/myVMD/ plugins/noarch/tcl
在这里插入图片描述
3. 把desityprofile1.1下的density_profile_init.tcl文件,拷贝到2中目录下的scripts/init.d,init.d文件夹不存在的话,新建一个,如下:
在这里插入图片描述
在这里插入图片描述
4.重新启动vmd,就能看到插件啦
在这里插入图片描述
在这里插入图片描述
选原子的语法就是VMD的常用语法,十分强大,可以选取任意的范围和原子

备注:关注公众号:“理论与计算化学初学者” 回复 “vmd密度” 获取插件文件(desityprofile1.1)

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