LSF usage

Vinson_Yin

已于 2024-03-15 17:08:56 修改

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分类专栏： environment 文章标签： LSF

于 2024-03-15 11:32:47 首次发布

本文链接：https://blog.csdn.net/ocarvb/article/details/136734424

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本文介绍了在LSF(LoadSharingFacility)环境下，如何使用bsub命令进行作业调度，包括执行预执行和后执行命令、利用LSB_JOBID环境变量、以及管理组作业、查看队列状态和终止作业的相关操作。

摘要由CSDN通过智能技术生成

bsubs

option	description	example
-E	Runs the specified job-based pre-execution command on the execution host before actually running the job.
-Ep	Runs the specified job-based post-execution command on the execution host after the job finishes.
-e	Appends the standard error output of the job to the specified file path.
-g	group job	bsus -g /group_job_name

bsub  -E 'echo pre > pre.${LSB_JOBID}.log' -Ep 'echo post > post.${LSB_JOBID}.log' sleep 10

环境变量LSB_JOBID是LSF为每一个作业设置的专有环境变量，内容为作业ID

bsub -o lsf/`date +%Y%m`/%J.out -e lsf/`date +%Y%m`/%J.err

-w:

bsub -g /group_job_name

bkill -g /group_job_name 0

bsub -q gui -I calibre -drc -batch & pid=$!

function nk_jobid {
    output=$($*)
    echo $output | head -n1 | cut -d'<' -f2 | cut -d'>' -f1
}

jobid=$(nk_jobid bsub pwd)

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