很愚蠢的一点,输入wget之后,就放假回家去了,导致今天上班的时候才发现下载到20%的时候失败了........
浏览器下载失败,转用wget URL的形式失败,改为采用:
下载完成后,进行如下操作:
而后,unzip gatk-4.0.2.1.zip文件,cd gatk-4.0.2.1后,ls下:
--->新的环境需求,嗯,对的,目标是先local配置下gatk,然后运行下样例文件,所以,继续配置所需要的环境配置
1:GATK4.beta.3 or later
由于之前已经安装了,这里就先不安装了。
2:Picard2.x
3:Samtools
4:Python 2.7
5:Cromwell
首先,下载cromwell相应版本的jar包,这里下载的是30.2&#x