GEE必须会教程——Savitzky-Golay（S-G）滤波器在Sentinel影像时间序列数据的应用

最新推荐文章于 2024-07-22 23:16:33 发布

Promising_GEO

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文章标签： python 前端开发语言 javascript GEE

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1964年，发表在《Analytical Chemistry》上的一篇名为“Smoothing and Differentiation of Data by Simplified Least Squares Procedures”引起了学界关注，该篇论文针对当时时间序列数据的分析和处理中面临的普遍需求，即“如何在保留信号特征的同时平滑数据和减少噪声”，提出了一种切实有效的方法，为化学光谱数据的平滑和微分处理开辟了新路径。Paper的作者为Abraham Savitzky 和 Marcel J. E. Golay，后世将这种时间序列数据的平滑和去噪方法称之为Savitzky-Golay滤波方法，这就是S-G滤波的由来。

尽管S-G滤波提出之初，主要是针对化学光谱数据的，但在分析遥感数据时，大部分时候，我们主要也是针对影像的波段光谱数据展开分析，因此S-G滤波器同样也适用于遥感影像的时间序列数据分析。今天，跟着小编来看看GEE上怎么实现S-G滤波分析。

1 S-G滤波器概要

在进行遥感影像处理时，常常需要处理大量的数据。这些数据通常包含噪声，这些噪声可能来自遥感平台自身误差、大气扰动或者地物周围环境的干扰。因此，在实际应用过程中需要一种方法来平滑数据，提取方便研究者开展分析的光谱信息特征，同时去除噪声。

在S-G滤波提出之前，常用的平滑方法包括移动平均滤波和加权平均滤波，大家或多或少在进行数据处理的时候都用过。这些方法虽然能够平滑数据，但往往会模糊数据中的重要特征（如峰值和谷值），导致信号失真。

S-G滤波方法提出后，受到学界欢迎的原因就是，他真的太好用了！！在平滑数据的同时，能够很好地保留信号中的局部特征，如峰值和谷值。这在光谱分析、时间序列分析等领域尤为重要。

2 S-G滤波原理

S-G滤波基于最小二乘法的平滑方法进行。

首先，定义滑动窗口的大小，在每个滑动窗口内，使用一个多项式函数来拟合数据点。这个多项式函数的阶数可以根据具体需求进行选择（通常是二次或三次多项式），接着，使用最小二乘法确定多项式的系数，以便拟合曲线与滑动窗口内的数据点尽可能匹配。拟合后的多项式值用于替代窗口中心点的原始数据值。最后，滤波器在整个数据序列上以固定长度的窗口进行滑动，对每个窗口内的数据点重复进行多项式拟合和平滑处理，完成整个时间序列数据的处理。

如果想进一步了解S-G滤波的原理，请看大佬文章（我是没看懂hhhh，大家看懂了教教我~~~）：

http://t.csdnimg.cn/bJ1HA

http://t.csdnimg.cn/cpr2c

3 应用S-G滤波器的一般步骤

一般而言，Savitzky-Golay滤波在遥感影像时间序列分析中的应用主要包括以下几个步骤：

第一步数据准备：获取并预处理遥感影像数据，计算时间序列指标。该部分需要基于GEE平台访问影像数据，并根据想要构建的目标指数（NDVI、EVI）等合成时间序列。

第二步滤波参数选择：选择适当的窗口大小和多项式阶数。窗口的大小和多项式阶数会影像滤波的效果，前者决定了覆盖的时间范围，且窗口越大，平滑效果越强，但是容易造成数据丢失；后者越大，表明拟合关系越复杂，但精度更高

第三步应用S-G滤波：使用第二步选择的参数对时间序列数据进行S-G滤波。

第四步结果分析：对比原始和平滑后的时间序列数据，提取其中的趋势和周期性变化进行进一步分析。

4 代码示例

接下来，我们以江西庐山某地区为例，一起来看看如何应用S-G滤波器对该区的NDVI时间序列数据展开分析。

Ⅰ生成NDVI时间序列

由于Sentinel影像在NIR和RED波段的空间分辨率较高，均为10m，因此我们在庐山地区选择了一小块区域进行实验，以免出现计算时内存溢出。

接下来我们上代码，依旧包括了几个步骤，卫星数据访问、去云、选用B4，B3波段计算NDVI并添加波段。

var s2 = ee.ImageCollection("COPERNICUS/S2"); 
var geometry = ee.FeatureCollection(ee.Geometry.Polygon(
        [[[115.90071074526553,29.493898535399506],
          [116.07443205874209,29.493898535399506],
          [116.07443205874209,29.59425592477838],
          [115.90071074526553,29.59425592477838],
          [115.90071074526553,29.493898535399506]]], null, false));
var styling = {color:'red',fillColor:'00000000'}
Map.addLayer(geometry.style(styling), {}, 'Lushan')
Map.centerObject(geometry)
var geometry = geometry.geometry()
var startDate = ee.Date('2023-01-01')
var endDate = startDate.advance(1, 'year')

var filtered = s2
  .filter(ee.Filter.date(startDate, endDate))
  .filter(ee.Filter.lt('CLOUDY_PIXEL_PERCENTAGE', 30))
  .filter(ee.Filter.bounds(geometry))

// 定义一个去云函数
function maskS2clouds(image) {
  var qa = image.select('QA60')
  var cloudBitMask = 1 << 10;
  var cirrusBitMask = 1 << 11;
  var mask = qa.bitwiseAnd(cloudBitMask).eq(0).and(
             qa.bitwiseAnd(cirrusBitMask).eq(0))
  return image.updateMask(mask)//.divide(10000)
      .select("B.*")
      .copyProperties(image, ["system:time_start"])
}

var filtered = filtered.map(maskS2clouds)


// 定义一个计算NDVI的函数并添加波段
function addNDVI(image) {
  var ndvi = image.normalizedDifference(['B8', 'B4']).toFloat().rename('ndvi');
  return image.addBands(ndvi);
}


// 对数据集进行循环遍历
var withNdvi = filtered.map(addNDVI);

// 挑选NDVI波段
var ndviCol = withNdvi.select('ndvi')
print('Original Collection', ndviCol)

Ⅱ创建一个包含n天影像的空时间序列数据

//确定时间间隔，按照间隔插入空白影像
var n = 7;
var totalDays = endDate.difference(startDate, 'day');
var daysToInterpolate = ee.List.sequence(1, totalDays, n)

var initImages = daysToInterpolate.map(function(day) {
  var image = ee.Image().rename('ndvi').toFloat().set({
    'system:index': ee.Number(day).format('%d'),
    'system:time_start': startDate.advance(day, 'day').millis(),
    // 设置属性，以便分辨插值影像
    'type': 'interpolated'
  })
  return image
})

var initCol = ee.ImageCollection.fromImages(initImages)
print('Empty Collection', initCol)

此处创建一个包含n天（这里设置为一周时间）的时间序列数据，源于在处理哨兵-2卫星的遥感数据时，由于其两个传感器（Sentinel-2A 和 Sentinel-2B）每天可能会产生多景影像，所以我们需要对一定时间范围内的NDVI计算结果取平均。最后，原来的多景影像将减少：

Ⅲ使用Join连接前后图像

var mergedCol = ndviCol.merge(initCol)

var mergedCol = mergedCol.map(function(image) {
  var timeImage = image.metadata('system:time_start').rename('timestamp')
  var timeImageMasked = timeImage.updateMask(image.mask().select(0))
  return image.addBands(timeImageMasked)
})

// 指定时间窗口
// 设置改窗口以便我们在该时间段包含无云影像
var days = 30
var millis = ee.Number(days).multiply(1000*60*60*24)

var maxDiffFilter = ee.Filter.maxDifference({
  difference: millis,
  leftField: 'system:time_start',
  rightField: 'system:time_start'
})

var lessEqFilter = ee.Filter.lessThanOrEquals({
  leftField: 'system:time_start',
  rightField: 'system:time_start'
})


var greaterEqFilter = ee.Filter.greaterThanOrEquals({
  leftField: 'system:time_start',
  rightField: 'system:time_start'
})


var filter1 = ee.Filter.and(maxDiffFilter, lessEqFilter)
var join1 = ee.Join.saveAll({
  matchesKey: 'after',
  ordering: 'system:time_start',
  ascending: false})
  
var join1Result = join1.apply({
  primary: mergedCol,
  secondary: mergedCol,
  condition: filter1
})

var filter2 = ee.Filter.and(maxDiffFilter, greaterEqFilter)

var join2 = ee.Join.saveAll({
  matchesKey: 'before',
  ordering: 'system:time_start',
  ascending: true})
  
var join2Result = join2.apply({
  primary: join1Result,
  secondary: join1Result,
  condition: filter2
})

Ⅳ应用线性插值方法填充每个图像


var filtered = join2Result.filter(ee.Filter.eq('type', 'interpolated'))

// 设置插值函数
function interpolateImages(image) {
  var image = ee.Image(image)

  var beforeImages = ee.List(image.get('before'))
  var beforeMosaic = ee.ImageCollection.fromImages(beforeImages).mosaic()
  var afterImages = ee.List(image.get('after'))
  var afterMosaic = ee.ImageCollection.fromImages(afterImages).mosaic()

  var t1 = beforeMosaic.select('timestamp').rename('t1')
  var t2 = afterMosaic.select('timestamp').rename('t2')

  var t = image.metadata('system:time_start').rename('t')

  var timeImage = ee.Image.cat([t1, t2, t])

  var timeRatio = timeImage.expression('(t - t1) / (t2 - t1)', {
    't': timeImage.select('t'),
    't1': timeImage.select('t1'),
    't2': timeImage.select('t2'),
  })

  var interpolated = beforeMosaic
    .add((afterMosaic.subtract(beforeMosaic).multiply(timeRatio)))
  var result = image.unmask(interpolated)
  return result.copyProperties(image, ['system:time_start'])
}

var interpolatedCol = ee.ImageCollection(
  filtered.map(interpolateImages)).select('ndvi')
print('Interpolated Collection', interpolatedCol)

Ⅴ应用S-G滤波方法

var oeel=require('users/OEEL/lib:loadAll');

// Use the same maxDiffFilter we used earlier
var maxDiffFilter = ee.Filter.maxDifference({
  difference: millis,
  leftField: 'system:time_start',
  rightField: 'system:time_start'
})

// Use the default distanceFunction
var distanceFunction = function(infromedImage, estimationImage) {
  return ee.Image.constant(
      ee.Number(infromedImage.get('system:time_start'))
      .subtract(
        ee.Number(estimationImage.get('system:time_start')))
        );
  }

// Apply smoothing of order=5
var order = 5;
var smoothed = oeel.ImageCollection.SavatskyGolayFilter(
  interpolatedCol, 
  maxDiffFilter,
  distanceFunction,
  order)

// Select the d_0_ndvi band and rename it
var smoothed = smoothed.select(['d_0_ndvi'], ['smoothed'])

Ⅵ生成可视化图表


// 对指定地点生成可视化图表
var title = 'Savitsky-Golay smoothing' +
  '(order = '+ order + ', window_size = ' + days + ')'

// 生成原时间序列和平滑后的时间序列图表
var chart = ui.Chart.image.series({
  imageCollection: ndviCol.merge(smoothed),
  region: geometry,
  reducer: ee.Reducer.mean(),
  scale: 10
}).setOptions({
      lineWidth: 1,
      title: title,
      interpolateNulls: true,
      vAxis: {title: 'NDVI'},
      hAxis: {title: '', format: 'YYYY-MMM'},
      series: {
        0: {color: 'blue', lineWidth: 1, 
          lineDashStyle: [1, 1], pointSize: 1,
          }, // Original NDVI
        1: {color: 'red', lineWidth: 2 }, // Smoothed NDVI
      },

    })
print(chart)

好了，经过上面的一通操作，我们得到了NDVI数据的S-G滤波结果，基本保留了原时间序列数据的形状、趋势，将高低频噪声进行有效平滑后，我们更能看出NDVI时间序列的变化趋势和大致的周期，是不是很有用呢。

最后，节目最后，发发疯:

很难嘛，难也要继续学啊！明天还是一条好汉！加油加油！

好了，今天的分享到这里就结束了，更多内容欢迎同步关注小编的公众号——梧桐GIS，咱们下期再会啦！！

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GEE必须会教程——Savitzky-Golay（S-G）滤波器在Sentinel影像时间序列数据的应用

此处创建一个包含n天（这里设置为一周时间）的时间序列数据，源于在处理哨兵-2卫星的遥感数据时，由于其两个传感器（Sentinel-2A 和 Sentinel-2B）每天可能会产生多景影像，所以我们需要对一定时间范围内的NDVI计算结果取平均。好了，经过上面的一通操作，我们得到了NDVI数据的S-G滤波结果，基本保留了原时间序列数据的形状、趋势，将高低频噪声进行有效平滑后，我们更能看出NDVI时间序列的变化趋势和大致的周期，是不是很有用呢。，因此S-G滤波器同样也适用于遥感影像的时间序列数据分析。
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