零基础构建基于LangChain的聊天机器人(7)

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  • 零基础构建基于LangChain的聊天机器人(1)
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设计医院系统图数据库

现在有了一个运行中的Neo4j AuraDB实例,接下来确定要存储哪些结点、关系和属性。一种流行的表示方式是使用流程图。基于对医院系统数据的理解,流程图设计如下:

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这个图展示了医院系统数据中的所有结点和关系。研究这个流程图的合适方式是从一个患者结点(Patient)开始,通过关系,到下一步 Patient 执行针对某个 Hospital 的 Visit 操作,然后是该医院的医生(Physician)给该病人治疗(TREATES),这次治疗的费用由 Payer 支付。

以下是每个结点中存储的属性:

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这些属性中的大部分直接来自步骤 2 中的字段。一个值得注意的区别是,Review 结点有一个嵌入属性,这是 patient_name、physician_name 和 text 属性的向量表示。允许对 Review 结点进行向量搜索,就像对 ChromaDB 所做的那样。

以下是关系属性:

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COVERED_BY 是唯一一个有超过一个 id 属性的关系。service_date 是患者出院的日期,billing_amount 是向支付方收取的费用。

现在已经对将要使用的医院系统设计有了概述,接下来将数据移入 Neo4j 。

将数据上传到Neo4j

有了运行中的Neo4j实例,以及对要存储的结点、属性和关系的理解,可以将医院系统数据移入Neo4j。为此,创建一个名为hospital_neo4j_etl的文件夹,其中包含一些空文件。还需要在项目的根目录中创建一个docker-compose.yml文件:

在这里插入图片描述

.env 文件应该有以下环境变量:

OPENAI_API_KEY=<YOUR_OPENAI_API_KEY>

NEO4J_URI=<YOUR_NEO4J_URI>
NEO4J_USERNAME=<YOUR_NEO4J_URI>
NEO4J_PASSWORD=<YOUR_NEO4J_PASSWORD>

HOSPITALS_CSV_PATH=https://raw.githubusercontent.com/hfhoffman1144/langchain_neo4j_rag_app/main/data/hospitals.csv
PAYERS_CSV_PATH=https://raw.githubusercontent.com/hfhoffman1144/langchain_neo4j_rag_app/main/data/payers.csv
PHYSICIANS_CSV_PATH=https://raw.githubusercontent.com/hfhoffman1144/langchain_neo4j_rag_app/main/data/physicians.csv
PATIENTS_CSV_PATH=https://raw.githubusercontent.com/hfhoffman1144/langchain_neo4j_rag_app/main/data/patients.csv
VISITS_CSV_PATH=https://raw.githubusercontent.com/hfhoffman1144/langchain_neo4j_rag_app/main/data/visits.csv
REVIEWS_CSV_PATH=https://raw.githubusercontent.com/hfhoffman1144/langchain_neo4j_rag_app/main/data/reviews.csv

注意,已经将所有的 CSV 文件存储在 GitHub 上的一个公共位置。因为 Neo4j AuraDB 实例在云端运行,它无法访问本地机器上的文件,必须使用 HTTP 或直接将文件上传到实例。对于这个例子,可以使用上面的链接,或者将数据上传到另一个位置。

一旦 .env 文件写好,打开 pyproject.toml,它以 TOML 格式提供配置、元数据和定义的依赖项:

在这里插入图片描述

这个项目是一个基础的提取、转换、加载(ETL)过程,将数据移入Neo4j,所以它的依赖项只有neo4j和retry。ETL的主脚本是 hospital_neo4j_etl/src/hospital_bulk_csv_write.py 。这里无法包含完整的脚本,但后面将对 hospital_neo4j_etl/src/hospital_bulk_csv_write.py 执行的主要步骤有一个感觉。可以从本项目的源码中复制完整的脚本。

首先,导入依赖项,加载环境变量,并配置日志:

在这里插入图片描述
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从neo4j导入 GraphDatabase 类以连接到正在运行的实例。注意这里不再使用Python-dotenv来加载环境变量。相反,把环境变量传到运行脚本的Docker容器中。接下来,将定义函数,根据设计将医院数据移入Neo4j:

在这里插入图片描述
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首先,定义一个辅助函数 _set_uniqueness_constraints(),它创建并运行查询,强制每个节点具有唯一 ID。在 load_hospital_graph_from_csv() 中,实例化一个驱动程序连接到 Neo4j 实例,并为每个医院系统结点设置唯一性约束。

注意 load_hospital_graph_from_csv() 上附加的 @retry 装饰器。如果load_hospital_graph_from_csv() 因任何原因失败,这个装饰器将重试一百次,每次尝试之间有十秒的延迟。当Neo4j出现间歇性连接问题时,这很有帮助,通常通过重新建立连接来解决。然而,请确保检查脚本日志,看看错误是否多次复发。

接下来,load_hospital_graph_from_csv() 从各自的 csv 文件中加载每个节点和关系的数据,并根据图数据库设计将其写入Neo4j:

在这里插入图片描述
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每个结点和关系都从它们各自的 csv 文件中加载,并根据图数据库设计写入Neo4j。脚本的最后,调用 load_hospital_graph_from_csv() ,所有数据应该都会填充到Neo4j实例中。

编写完 hospital_neo4j_etl/src/hospital_bulk_csv_write.py 后,可以定义一个 entrypoint.sh 文件,当Docker容器启动时将运行:

在这里插入图片描述

这个 entrypoint 文件对于这个项目来说技术上并不是必需的,但在构建容器时是一个好习惯,因为它允许在运行主脚本之前执行必要的shell命令。

ETL的最后一个文件是 Dockerfile,它是这样的:

在这里插入图片描述

这个 Dockerfile 说明容器使用 python:3.11-slim 发行版,将 hospital_neo4j_etl/src/ 中的内容复制到容器内的 /app 目录中,从 pyproject.toml 安装依赖项,并运行 entrypoint.sh

现在可以将这个项目添加到 docker-compose.yml 中:

在这里插入图片描述

ETL将作为名为 hospital_neo4j_etl 的服务运行,它将使用位于 ``./hospital_neo4j_etl中的Dockerfile,并使用 .env中的环境变量。由于只有一个容器,现在还不需要docker-compose。然而,在下一节中,将添加更多的容器与ETL进行编排,所以现在开始使用 docker-compose.yml`是有帮助的。

要运行ETL,请打开一个终端并运行:

$ docker-compose up --build

一旦 ETL 完成运行,返回到 Aura 控制台:

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点击“Open”,系统将提示输入Neo4j密码。成功登录实例后,应该看到一个类似的显示:

图片

正如在“数据库信息”下看到的,所有结点、关系和属性都已加载。有 21,187 个结点和 48,259 个关系。

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  • 为什么要做 RAG
  • 搭建一个简单的 ChatPDF
  • 检索的基础概念
  • 什么是向量表示(Embeddings)
  • 向量数据库与向量检索
  • 基于向量检索的 RAG
  • 搭建 RAG 系统的扩展知识
  • 混合检索与 RAG-Fusion 简介
  • 向量模型本地部署

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  • 求解器 & 损失函数简介
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  • 什么是训练/预训练/微调/轻量化微调
  • Transformer结构简介
  • 轻量化微调
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