MRD选informed还是agnostic?我全都要

MRD检测在肿瘤管理中扮演关键角色,包括Tumor-informed和Tumor-agnostic两种策略。Tumor-informed基于肿瘤组织变异,定制化设计提高准确性,但成本高且需组织样本。Tumor-agnostic无需组织,检测快速,但可能漏掉某些变异。求臻医学提出MRD AI双驱动策略,结合两者优势。
摘要由CSDN通过智能技术生成

第二期

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近年来,随着早中期肿瘤患者预后管理相关研究的不断深入,肿瘤复发风险及分子残留病灶(MRD)已愈来愈受到临床的关注,并正在快速改变着肿瘤诊疗模式。求臻医学倾力打造“臻话MRD”系列文章,为您阐述MRD检测能为临床及患者带来的获益,解析不同的技术路径的区别,帮助挑选合适的MRD检测产品。


MRD检测是指在肿瘤患者经过治疗后,利用液体活检技术检测体内是否存在低于常规方法检测限的相关生物标志物。MRD检测可以评估治疗效果,预测复发风险,指导后续治疗方案。



Tumor-informed与Tumor-agnostic

上回提到,目前实体瘤MRD检测主要有两种策略:一种是基于肿瘤组织变异信息的肿瘤知情分析(Tumor-informed);另一种是不依赖肿瘤组织信息的肿瘤不知情分析(Tumor-agnostic,或Tumor-naive)。对于术后未呈现明显复发迹象的患者,其血浆中肿瘤来源的ctDNA含量一般极低,因此MRD检测的核心技术需往广度(ctDNA Panel对个体患者突变位点的覆盖程度)、深度(测序的深度)及精度(降噪能力)三个方向进行发展,以保证MRD结果的准确性。


 Tumor-informed法是指先对肿瘤组织进行NGS测序,找出肿瘤特有的克隆性单核苷酸变异(SNV),然后根据这些变异设计合成定制化Panel,对患者的血浆样本进行个性化追踪,从而检测和定量ctDNA。


 Tumor-agnostic法是指不需要肿瘤组织信息,而是直接对患者的血液样本进行NGS检测,利用预先设定的癌基因突变Panel或者机器学习算法,筛选出可能来自肿瘤的ctDNA变异。


Tumor-informed和Tumor-agnostic已在多种实体肿瘤(结直肠癌、乳腺癌、肺癌、尿路上皮癌等)开展了多个回顾性或前瞻性研究。这些研究表明,MRD检测可以作为复发风险和预后预测的指标,以及治疗反应和耐药性的监测手段。总体而言,Tumor-informed方法有更多更强的临床验证数据,而Tumor-agnostic方法还需要更多的证据支持 。




几种策略的优缺点分析基于WES+定制化Panel的Tumor-informed策略

每个肿瘤患者的突变谱具有较高的异质性,个体患者之间仅携带非常少量相同的基因突变。Tumor-informed通常基于对组织进行WES检测,覆盖面更广,因此可以针对个体肿瘤特有的变异进行定制化的设计和分析,避免漏掉一些低频或者未知的变异,可以提高检测的准确性和全面性。同时,因可以利用肿瘤组织和正常组织做对照,并且ctDNA检测Panel小(一般仅数Kb),测序深度高(可达10万×以上),Tumor-informed可很好区分出来自肿瘤的ctDNA信号,排除一些来自克隆性造血(CHIP)或者遗传性变异的干扰,可以提高检测的灵敏度和特异度。


然而

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