近日,国家卫生健康委临床检验中心(NCCL)公布了2023年“全国血液微生物cfDNA 宏基因组高通量测序室间质量评价预研活动结果报告”,合格率(≥90分)为78.46%,满分通过率仅为38%。求臻医学下属子公司杭州求臻医学检验实验室,以满分的优异成绩通过此次室间质评,mNGS cfDNA专业性获得国内权威机构认可。
室间质评结果报告
血浆游离DNA(cfDNA)宏基因组高通量测序(mNGS)可为多种类型血流感染病例的临床诊断提供重要的病原学依据。本次预研活动旨在了解国内mNGS实验室检测血浆微生物cfDNA 的现状,通过考察各实验室14个样本中39个cfDNA浓度达1.5×103copies/mL 及以上的细菌、真菌和DNA病毒的检出情况,对实验室检测结果的准确性、近缘菌株鉴定、报告解读等多个方面能力进行考核。
由于血浆中微生物cfDNA含量极低且高度片段化,易受实验室环境中微生物及其核酸污染导致假阳性结果,且mNGS检测流程非常复杂,对实验操作及实验室管理的要求很高,因此,不同实验室间的检测结果可能会出现较大的差异。数据显示,接受报名的实验室146家,实际收到130家有效回报结果。按照≥90分为合格的标准,合格率为78.46%(102/130),满分通过率仅为38%(50/130)。求臻医学检测病原体与样本预期结果完全一致,以满分的成绩通过考核,且无一例假阴性或假阳性。
图 1. 实验室成绩分布
图 2.实验室假阳性微生物检出情况
本次室间质评的满分通过,再次验证杭州求臻医学检验实验室mNGS方法从DNA提取、建库测序,到数据质控、物种分类、微生物数据库组成到阈值设定等各环节的科学性及及报告解读准确性,实验室有能力为临床提供精准、快速、可靠的病原学依据,助力临床精准诊疗。