欧洲生物信息学研究所(EMBL-EBI,European Molecular Biology Laboratory - European Bioinformatics Institute)位于英国剑桥附近的欣克斯顿,它是欧洲分子生物学实验室(EMBL)五个分部之一。EMBL 是一个由 27 个国家组成的政府间组织,旨在支持基础生物科学研究。EMBL - EBI 主要专注于生物信息学领域,其使命是为全球科研界提供生物信息资源和数据分析服务。
网址: https://www.ebi.ac.uk
主要职能
职能 | 说明 |
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数据库与知识库 | 负责全球数十个核心生物数据库的开发与维护 (如 UniProt, InterPro, Ensembl, PDBe 等) |
数据服务与托管 | 提供数据存储、访问、检索与共享服务,支持全球科学家 |
分析工具与软件 | 开发与托管生物信息学分析工具 (如 BLAST, InterProScan, Clustal Omega) |
研究 | 计算生物学、人工智能、生物大数据分析等领域的基础研究 |
培训与社区支持 | 组织培训课程、讲座、在线教程,推动全球生信能力建设 |
核心数据库 (部分)
数据库 | 领域 | 说明 |
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UniProt | 蛋白质序列与功能 | 全球权威蛋白质信息库 (联合SIB和PIR维护) |
InterPro | 蛋白质家族与结构域 | 整合多个结构域数据库,提供注释与功能预测 |
Ensembl | 基因组注释 | 多物种基因组注释平台 (与Sanger合作) |
PDBe | 蛋白质结构 | PDB欧洲分部,提供蛋白质三维结构数据 |
EMDB | 电镜数据 | 电子显微镜三维重构数据库 |
ChEMBL | 药物化学 | 药物-靶标信息与小分子生物活性数据 |
Expression Atlas | 表达组 | 转录组/蛋白质组表达数据 |
Europe PMC | 文献数据库 | 生物医学文献全文与摘要 (欧洲PubMed Central) |
科研方向 (研究组示例)
与 AlphaFold 关系
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EMBL-EBI 负责托管 AlphaFold Protein Structure Database (AlphaFold DB)
合作伙伴:DeepMind + EMBL-EBI
作用:提供 AlphaFold 预测的蛋白质结构模型,支持全体科学家免费访问
EMBL-EBI 的优势特色
✅ 全球最大生物数据库集群
✅ 公共免费数据,推动开放科学
✅ 强大的生信分析工具与API接口
✅ 国际合作 (如 ELIXIR 生命科学基础设施)