PyRadiomics 的初始化

 

import radiomics

paramsFile = 'dir_path/Params.yaml'
extractor = radiomics.featureextractor.RadiomicsFeaturesExtractor(paramsFile)
extractor.enableAllImageTypes()
features = extractor.execute(img, temp, label=1)

paramsFile ：定制要提取的图像类型与特征类的文件，yaml格式的文件。

    imageType: 设定要提取特征的图像类型，例：Original: {}

    featureClass：设定要提取的特征类，不指定则提取所有的特征类

        shape:
        shape:
           - 'MajorAxis'
        firstorder:
           - 'Kurtosis'
           - 'Skewness'

paramsFile 的制定也可以通过  loadParams（paramsFile）方法进行加载指定。

 

enableAllImageTypes() 指定获取所有的图像类型

 

execute（img， temp，label）  提取特征

    img ：SimuleTk图像，原始图像

    temp：带有标签的SimuleIk图像

    label：整数，用于提取特征的标签的值

 

特征提取的操作

1.  loadImage（imageFilepath, maskFilepath）    加载原始图像与mask

2. checkMask（image, mask, **self.settings）     检验原始图像与mask是否一致（原点/方向/间距等。。。）

3. 增加设定中附加的信息

4. 提取形状（shape）的特征

5. 根据设定重新设定mask

6. 根据启用的其它特征类提取特征值