PyMOL安装​

背景

由于作者的研究方向是生物信息学，经常需要对一些生物分子进行操作，需要一个可视化的操作软件，这个软件就是PyMOL。但是最近在安装PyMOL时出现了不少问题，而且很多问题在网上搜索都是没有办法解决的，所以想写一个教程帮助一下有需要的人。

介绍

PyMOL是一个开放源码，由用户赞助的分子三维结构显示软件。PyMOL适用于创作高质量的小分子或是生物大分子（特别是蛋白质）的三维结构图像。

安装环境

• WSL(Windows Subsystem for Linux)
• Ubuntu 22.04.3 LTS

安装过程

1. 使用Ubuntu 自带的apt进行安装。命令是sudo apt install pymol，安装完成之后，运行pymol出现下面的问题。
   网上寻找了一番，找到了一个相关解答，但是按照该解答进行操作，还是没有解决这个问题。
2. 第一种安装方式失败之后，决定使用conda进行安装。命令是conda install -c conda-forge -c schrodinger pymol-bundle，安装完成之后，运行出现了新的问题。
   也是搜索一番，找到一个相关解答，同样，按照这个解答进行操作，没有解决。
3. 经过上面两种在Ubuntu上安装软件的方式，作者决定直接从源码安装，做最后的尝试。从源码安装的教程在PyMOL的Wiki上已经给出来了，直接点击该链接就可以看到啦！
   最后放上安装成功的图片。

总结

我之前已经安装过好几次PyMOL了，在Windows和MacOS上都是直接安装成功了。主要还是因为之前的安装都是从官网上直接下载安装包，一键傻瓜式安装。这次的安装遇到的这些问题，其实并没有解决，所以如果有知道解决办法的朋友，可以直接联系我，我也想弄清楚因为什么。

参考

PyMOL的维基百科：https://zh.wikipedia.org/wiki/PyMOL
PyMOL教程：https://pymolwiki.org/index.php/Main_Page

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