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RSS订阅原创 使用GEO数据库获取感兴趣实验的差异表达基因
GEO是gene expression omnibus的缩写，我们可以在这个数据库中查看别人的芯片实验的结果，因此我们可以根据自己的实验需求去找相关的实验并找到这些实验中有显著差异表达的基因，具体的步骤如下：进入GEO Profiles https://www.ncbi.nlm.nih.gov/geoprofiles并输入感兴趣的实验关键词，这里我对疾病子痫感兴趣，因此我输入了子痫preecl...
2018-12-19 17:29:14
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原创 使用argparse来实现接收标准输入并默认输出到标准输出功能
文章目录简介使用 nargs使用nargs='?'简介有很多命令，例如awk，sed,cut等这些命令，都是可以接收来自管道符的标准输入，并且默认输出到标准输出。这些命令在找不到输入的文件的时候，就会去标准输入去找，这个功能非常的方便，现在我们使用argparse也可以实现这个功能。使用 nargsnargs是add_argument()方法的一个参数，该参数的特别之处在于指定参数后面值的...
2018-12-05 15:32:28
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原创 使用argparse实现像samtools一样的子命令，子程序并形成各自的帮助文档
文章目录简介使用add_subparsers()来创建子文档使用set_default()来管理各自功能的参数简介很多时候，我们的程序往往需要实现多个功能块，将这些功能块分开实现是一个好主意，而argparse可以帮助我们来实现易读的自命令和帮助文档。本文将介绍如何使用argparse来对具有多个功能的程序进行功能划分并写出各自子程序的帮助文档。参考文档为argparsehttps://do...
2018-12-04 18:10:51
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空空如也
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