GEO是gene expression omnibus的缩写,我们可以在这个数据库中查看别人的芯片实验的结果,因此我们可以根据自己的实验需求去找相关的实验并找到这些实验中有显著差异表达的基因,具体的步骤如下:
- 进入GEO Profiles https://www.ncbi.nlm.nih.gov/geoprofiles并输入感兴趣的实验关键词,这里我对疾病子痫感兴趣,因此我输入了子痫preeclampsia。
- 在搜索结果中,我们可以看到基因名称和相关的实验名称,下面列出了一些相关的实验内容,比如这里写了物种,探针名称,实验编号基因编号等,我们可以通过点击右侧的图来查看该基因在该实验中的各个样本的表达量情况。
- 点击图片查看该基因的表达情况
- 我们还可以通过左侧的选项来进一步的过滤我们关注的基因范围,一个