Cell-type–specific || 单细胞文章新范式

• 组织器官图谱
• 某一细胞类型异质性
• 细胞类型特异性分析

单细胞技术带给我们的精度可见一斑。最近注意到单细胞的文章题目有的朝着Cell type–specific（细胞类型特异性)发展了。之前的图谱是聚类后注释出细胞类型或者亚型，现在是分析每个亚型有什么别的特点。细胞能有什么特点呢？

什么是细胞类型，不就是基因选择性表达的结果吗？而基因的选择表达受到一系列的转录调控，在这个意义上，细胞命运背后的驱动力在于各自转录因子表达的程序化及其靶标基因。有的细胞类型里面是不是有其特异的转录因子呢？有。而细胞类型一旦形成，他又需要通过表观遗传机制来记忆并把其身份传递给子代细胞。那么，有的细胞类型里面是不是有特异的表观遗传现象？有。

所以，所谓的细胞类型特异的，指的是什么？

• 基因
• 转录因子
• 表观遗传

细胞类型特异性来自基因调控和表达模式的特异性，最后落脚在了基因上。

来看，小哥哥给你们化的简笔画：

举几个例子：

Cell-type-specific analysis of alternative polyadenylation using single-cell transcriptomics data

Cell-Type-Specific Complement Expression in the Healthy and Diseased Retina

Cell type–specific genetic regulation of gene expression across human tissues

 

作者：周运来就是我
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来源：简书
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