clr中心对数转换

本文介绍了R语言中的centered log-ratio (clr)转换,用于处理compositional data。clr转换通过计算几何平均值并进行对数运算,使数据满足特定的统计性质。在分析XRF数据的土壤/岩石元素分析时,转换后结果相加为0,正数值表示相对较大,负数值表示相对较小。需要注意的是,原始数据中若包含0,则需要处理,可以通过赋值或重采样解决。
摘要由CSDN通过智能技术生成

centered log-ratio transformation(clr)

这是本🐏的第 2 篇文稿。
最近在看用XRF数据进行土壤/岩石样品的元素分析。我同事对数据进行centered log-ratio transformation。蠢笨如我看了好几天,也没太搞懂,为什么要进行转换。以及转换后,如何看这个数据。
下面是几点简单的体会把。

clr转换的基本概念

  1. 首先明白一个概念,compositional data (根据维基百科的定义:指在统计学中,组成数据是对某些整体的各个部分的定量描述,传达了相关信息。在数学上,组成数据由单形上的点表示。涉及概率,比例,百分数和ppm的测量都可以被认为是成分数据。mg·kg-1, ppm, %)
  2. clr就是要对compositional data的各个元素进行转换。

c l r ( x ) = [ l n x 1 g ( x ) ; … ; l n x D g ( x ) ] clr(x) = [ln \frac{x_ {1}}{g(x)};…; ln \frac{x_ {D}}{g(x)}] clr(x

  • 13
    点赞
  • 41
    收藏
    觉得还不错? 一键收藏
  • 8
    评论
CLR中心对数变换(Centered Log-Ratio Transformation)是一种常用的数据转换方法,用于处理成分数据。成分数据是指由多个互相依赖的部分组成的数据,例如化学组分、地球化学元素或其他多元数据。CLR转换可以将成分数据转换为真实空间,使其在统计分析中更加可靠和有效。 在CLR转换中,首先需要计算各个成分之间的相对比例。然后,取每个成分相对比例的自然对数,并对其进行中心化处理,即减去该组数据的均值。最后,再对中心化后的对数比例进行标准化处理,以确保数据总和为零。这样可以消除成分之间的相关性,并将数据转换为一个新的坐标系,使得统计分析更加准确和可靠。 CLR中心对数变换常用于多元数据的分析,例如在地质学、生态学、化学等领域中,用于处理成分数据的形态和相互关系。它可以帮助研究人员更好地理解各个成分之间的变化趋势、相互作用和影响因素,从而提供更精确和可靠的统计分析结果。 参考文献: 可以使用扰动和功率运算来分析成分数据,这对于模拟研究很有用。另一种策略是将成分数据转换为真实空间。现在,可以使用中心对数变换 (CLR)和等距对数变换 (ILR)来完成此操作。此转换可用于执行标准统计的前提,例如参数假设检验、回归等。 有一篇文献说到:地质学家为什么要使用成分数据分析?本文除了原理的一些讲解外,案例全部有python实现。同时除了会讲到CLR方法,还会提到一些其它的方法,比如等距对数变换、加法对数比率变换等。<span class="em">1</span><span class="em">2</span><span class="em">3</span> #### 引用[.reference_title] - *1* [CLR编程,CLR 原理,CLR 内幕](https://download.csdn.net/download/lxming188/3331847)[target="_blank" data-report-click={"spm":"1018.2226.3001.9630","extra":{"utm_source":"vip_chatgpt_common_search_pc_result","utm_medium":"distribute.pc_search_result.none-task-cask-2~all~insert_cask~default-1-null.142^v93^chatsearchT3_2"}}] [.reference_item style="max-width: 50%"] - *2* *3* [数学建模学习(102):成分数据分析之中心对数转换【已修改】](https://blog.csdn.net/weixin_46211269/article/details/127177660)[target="_blank" data-report-click={"spm":"1018.2226.3001.9630","extra":{"utm_source":"vip_chatgpt_common_search_pc_result","utm_medium":"distribute.pc_search_result.none-task-cask-2~all~insert_cask~default-1-null.142^v93^chatsearchT3_2"}}] [.reference_item style="max-width: 50%"] [ .reference_list ]
评论 8
添加红包

请填写红包祝福语或标题

红包个数最小为10个

红包金额最低5元

当前余额3.43前往充值 >
需支付:10.00
成就一亿技术人!
领取后你会自动成为博主和红包主的粉丝 规则
hope_wisdom
发出的红包
实付
使用余额支付
点击重新获取
扫码支付
钱包余额 0

抵扣说明:

1.余额是钱包充值的虚拟货币,按照1:1的比例进行支付金额的抵扣。
2.余额无法直接购买下载,可以购买VIP、付费专栏及课程。

余额充值