R语言ggplot2绘制分组箱型图和分组柱状图

需求

论文中常见的分组箱型图和分组条形图可以直观的比较方法的效果，以一个图显示多个方法在多个数据集上的AUC或AUPR。

抽象出来的数据即包含2个分类变量和1个连续变量，

不同的方法（分类变量1）在不同的条件下（分类变量2）的一个评价指标（数值型，连续变量）上的结果，可进行方法比较，也可进行条件比较。

 

 

环境

安装并加载包

library(ggplot2)

分组条形图

数据：

评价指标：AUC

方法：A、B、C、D

条件：Dataset1-5

作图函数

#读入数据文件
databar=read.csv(file='databar.csv',header = T,stringsAsFactors = F)
q1<-ggplot(data=databar, mapping=aes(x = Dataset, y = AUC,fill=Methods))+
  geom_bar(stat="identity",position=position_dodge(0.75))
q1

关于geom_bar()函数详解见https://www.jianshu.com/p/e443edd76daa

部分内容详解：

1.mapping：

x对应条形图的x轴（条件），y对应y轴数据（评价指标），fill对应图中的分类变量（方法）

2.设置stat="identity"，

条形的高度表示数据的值，由aes()函数的y参数决定的

3.position参数：

默认position="stack"，这时是堆叠条形图

position还可以为以下几种取值：

fill 堆叠元素，并标准化为1；dodge避免重叠；identity不做任何调整；jitter给点添加扰动避免重合；stack将图形元素堆叠起来。

为了表现为分组条形图，设置position="dodge"或position=position_dodge(0.75)表示各个矩形条之间的距离

图形美化

仅靠默认绘出的图是不够的，进行一些必要的美化才能达标嘛

调整条形图的组间间隔

并没有找到能直接调整组间间隔的方法，最终的方式是通过“调节组内间距和bar的宽度”的方式，

通过组内间隔position_dodge(0.7)>矩形条的宽度width=0.5达到的效果

geom_bar(stat="identity",position=position_dodge(0.7),width=0.5)
#width 设置矩形条的宽度

对比原图，可以看出一个数据集内，不同方法的bar之间的间隔拉开了，并且不同数据集上的结果之间的间隔也拉开了。