Cox构建预测模型(4):如何用R语言绘制cox预测模型列线图?(附全套代码)

临床预测模型(clinical prediction model),是指利用数学模型估计研究对象当前患有某病的概率或者将来发生某种结局的可能性。也就是说,临床预测模型是通过已知特征来预测未知,而模型就是一个数学公式,也就是把已知的特征通过这个模型计算出未知结局发生的概率。

列线图就是最为常见的一种预测模型,许多预测模型类文章中都有它的身影。前面已经为大家介绍了预测模型中训练集与验证集的均衡性比较、Cox回归筛选预测因子,今天继续通过R语言复现seer公共数据库的文章,来为大家介绍绘制列线图的方法。

一、文献解读

案例文献是沈阳医学院公共卫生学院学者基于SEER数据库的一项回顾性研究,旨在建立一个列线图来预测老年恶性骨肿瘤(MBT)患者的总生存期(OS)。

1. 摘要

背景:恶性骨肿瘤(MBT)是老年患者死亡的原因之一。我们研究的目的是建立一个列线图来预测老年MBT患者的总生存期(OS)。

方法:从SEER数据库下载了2004年至2018年所有老年MBT患者的临床病理数据。他们被随机分配到训练集(7

Cox回归是一种常用于生存分析的统计方法,用于研究事件发生时间与影响因素之间的关系。R语言是一种广泛使用的统计分析工具,它可以用于绘制Cox回归的列线图。 要绘制Cox回归的列线图,首先需要使用R中的survival包来进行生存分析和Cox回归分析。survival包提供了用于处理生存数据的函数,其中包括进行Cox回归的函数。 在进行Cox回归分析之后,我们可以得到每个影响因素的估计系数以及相应的标准误差。根据这些结果,我们可以计算出每个影响因素的风险比(Hazard Ratio)以及相应的置信区间。 接下来,我们可以使用R中的ggplot2包来绘制列线图。ggplot2是一个功能强大的绘图工具,它提供了灵活的图形语法,可以使图形的绘制变得更加简洁和美观。 在绘制Cox回归的列线图时,我们可以将每个影响因素的风险比绘制为柱状图,并在柱状图上添加误差线表示置信区间的范围。此外,我们还可以使用颜色或其他图形属性来区分不同的影响因素。 最后,我们可以添加标题、轴标签和图例等细节,使图形更加清晰易懂。通过观察列线图,我们可以直观地了解每个影响因素对事件发生时间的影响程度,以及它们的置信区间。 总之,使用R语言中的survival包进行Cox回归分析,然后利用ggplot2包绘制列线图,可以帮助我们更好地理解影响因素对事件发生时间的影响。这样的图形可以为研究者提供直观、清晰的结果展示,进一步助力生存分析的解释和模型解读。
评论
添加红包

请填写红包祝福语或标题

红包个数最小为10个

红包金额最低5元

当前余额3.43前往充值 >
需支付:10.00
成就一亿技术人!
领取后你会自动成为博主和红包主的粉丝 规则
hope_wisdom
发出的红包
实付
使用余额支付
点击重新获取
扫码支付
钱包余额 0

抵扣说明:

1.余额是钱包充值的虚拟货币,按照1:1的比例进行支付金额的抵扣。
2.余额无法直接购买下载,可以购买VIP、付费专栏及课程。

余额充值