全网最系统的单细胞测序细胞互作/细胞通讯分析课程

最新推荐文章于 2024-04-29 14:29:16 发布
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解密ATAC中的测序饱和度分析
庐州月光的博客
01-03 1842
欢迎关注”生信修炼手册”!测序数据量对于NGS数据分析是非常重要的，测序数据量过低，不能有效覆盖基因组完整信息，测序数据量过高，则会造成冗余，不够经济。为了验证当前测序量能否满足需求，或...
单细胞测序拟时间序列分析R包monocel教程（附4个学习案例）
12-20
monocel是目前单细胞测序数据分析中最常用的拟时间序列分析R语言包，本教程是官方文档外附了4个学习案例
哇！单细胞测序-配体受体互作分析原来可以这么简单又高大上！
悟道西方
02-24 7210
NGS系列文章包括NGS基础、转录组分析 （Nature重磅综述|关于RNA-seq你想知道的全在这）、ChIP-seq分析 （ChIP-seq基本分析流程）、单细胞测序分析 (重磅综述：三万字长文读懂单细胞RNA测序分析的最佳实践教程 （原理、代码和评述）)、DNA甲基化分析、重测序分析、GEO数据挖掘（典型医学设计实验GEO数据分析 (step-by-step) - Limma差异分析、火山图...
分析方法，单细胞测序之细胞互作
leroylee7的博客
10-28 2896
今年张泽民团队与其合作团队在Cell发表的一篇文章将细胞交互运用自如【1】，该研究手段值得借鉴。肿瘤微环境由很多细胞类型组成，每一种细胞类型的异质性，如肿瘤细胞的不同克隆或免疫细胞的不同亚群，进一步增加了肿瘤微环境的复杂性。不同细胞类型的通讯广泛参与肿瘤的发生与发展、免疫浸润、免疫逃逸、炎性等多种生物学机制。该文章构建了细胞-细胞交互网络，定义了调控肿瘤生成与抗肿瘤免疫的关键细胞群体，发现特异的肿瘤相关巨噬细胞与树突状细胞群体是细胞交互网络中的hub节点（网络枢纽，连接不同的细胞群体）。推荐这篇文章的主要原
单细胞文章解读——用单细胞RNA测序技术分析与肿瘤转移相关的细胞间通讯
zbandzsxj的博客
04-21 5548
题目：Analysis of Single-Cell RNA-Seq Identifies Cell-Cell Communication Associated with Tumor Characteristics
Q&A_全网最系统的单细胞测序细胞互作/细胞通讯分析课程
TOP生物信息
03-20 529
课程介绍见本网页的答疑记录来自。
单细胞分析实录(12): 如何推断肿瘤细胞
TOP生物信息
04-18 5480
公众号后台回复20210418，获取本文的测试数据 1. 回顾 前面我已经讲解了inferCNV的基本用法，这一节继续学习：如何推断肿瘤细胞。本文应该是到目前为止，全网最详细的帖子（之一）。 关于肿瘤细胞的推断，比如研究上皮细胞起源的肿瘤，我见过的一些做法如下 简单粗暴型：将来源肿瘤病灶的所有上皮细胞都看成是肿瘤细胞 看CNV：将来源于肿瘤病灶的上皮细胞和参考细胞比较，将那些有明显CNV的细胞看作肿瘤细胞 看表达特征：考虑到有的肿瘤细胞可能没有CNV层面的变化，有的文章会根据肿瘤与正常的表达谱来区分是.
scanpy单细胞分析官网示例全解析（一）全网最详细及细节
cuixueyi的博客
01-21 1739
scanpy使用分享
全网最完整的circos中文教程
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庐州月光的博客
11-10 1万+
欢迎关注”生信修炼手册”!circos 是一款染色体相关数据的可视化软件，采用圆环的形式展示染色体上的相关信息，在多种组学数据的展示中广泛应用，本文整理了之前推送过的circos相关的学...
2024.4.29复盘——SCI论文插图全网最全干货
最新发布
weixin_43150646的博客
04-29 1767
1. 基础常识篇 2. SCI插图规范 3. SCI论文图片编辑过程中典型问题总结 4. 超实用的作图技巧总结——大佬经验
单细胞测序工作流程 :关键步骤和注意事项 .pdf
09-26
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单细胞测序
08-06
一篇关于单细胞测序malbac方法的文章
基于子空间对齐的单细胞转录...测序数据的细胞类型预测研究-张柳
04-15
源域和 目 标域 的子空 间 实现数据 降 维 、 批次 效应校正和 细胞类型预测 。 首先 ， 对源 域和 目 标域进行数据预 处理并通过主 成分分析构 建子空 间 坐标系 ； 其次 ， 通过子 空 间 对齐得 到 目 标对齐源...
metacells:元细胞-单细胞RNA测序分析
04-22
元细胞分析天真的，scRNA_seq数据是一组细胞谱，其中对于每个基因，对于每个基因，我们获得该基因在细胞中存在的mRNA分子的计数。 这可作为该基因“表达”或“活跃”程度的指标。 就像在任何现实世界的技术中一样，...
QT属性动画--设置样式属性(其他属性)
lizequan的博客
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这里写自定义目录标题故事背景遇到的问题解决过程最终方法感悟 故事背景   最近在制作一个按钮切换的动画特效中接触了属性动画这部分内容，并由此产生了一些思考。 遇到的问题 解决过程 最终方法 感悟 ...
Volatile的其他特性
我想月薪过万的博客
03-03 3683
2.1 volatile总体概览 在上一节中，我们已经研究完了volatile可以实现并发下共享变量的可见性，volatile除了保证可见性外，volatile还具备如下一些突出的特性： volatile的原子性问题：volatile不能保证原子性操作 禁止指令重排序：volatile可以防止指令重排序操作 2.2 volatile不保证原子性 2.3 代码测试 package Ls; /** * 目标：研究Volatile的原子性操作 * <p> * 基本观点：V.
【安卓基础】Android直接通过路径来操作其他应用的私有目录，可以吗？
m0_48179608的博客
03-02 7329
在上篇文章[【安卓基础】一文搞懂Android历代版本文件访问权限变化](https://blog.csdn.net/m0_48179608/article/details/122838494)我们对同一个应用的的文件访问权限做了比较。 那么不同应用之间文件访问又有什么限制呢？我们准备分二到三篇文件来阐述。 这篇文章，主要来看下不同系统版本下，我们直接通过路径来访问其它应用的**内部存储、外部存储私有目录**，看看能不能访问以及不同系统版本的区别。
Silane-PEG-NHS，SIL-PEG-NHS，可以用来修饰蛋白质、多肽以及其他活性基团，NHS-PEG-Silane
qq_39152602的博客
03-03 3335
英文名称：Silane-PEG-NHS 中文名称：硅烷-聚乙二醇-活性酯 分子量：1k，2k，3.4k，5k，10k，20k（可按需定制） 质量控制：95%+ 存储条件：-20°C，避光，避湿 用 途：仅供科研实验使用，不用于诊治 外观: 固体或粘性液体，取决于分子量 注意事项：取用一定要干燥，避免频繁的溶解和冻干 溶解性：溶于大部分有机溶剂，如：DCM、DMF、DMSO、THF等等。在水中有很好的溶解性 取用：现配现用，将包装从冰箱中取出，置于干燥器中缓慢升至室温，打开瓶盖，取用。取用.
单细胞测序r语言分析
10-16
单细胞测序（single-cell sequencing）是一种高通量测序技术，可以对单个细胞的基因组或转录组进行全面的分析。而R语言是一种广泛用于统计分析和数据可视化的编程语言。 在单细胞测序实验中，通过测序技术可以获取到大量的细胞的基因表达数据，包括每个细胞中数以千计的基因的表达水平。而这些数据的处理和分析就需要使用到R语言以及相关的数据分析包和函数。 首先，我们可以使用R语言中的数据读取函数将单细胞测序的原始数据导入到R环境中，并进行数据清洗和预处理。例如，可以通过R的数据处理包如‘Seurat’对单细胞数据进行降噪、标准化和归一化等处理，以确保数据的准确性和可靠性。 接下来，我们需要使用R语言的统计分析技术对这些单细胞数据进行分析。例如，可以通过差异表达分析（DEG）来寻找在不同细胞类型或条件下差异表达的基因。也可以使用聚类算法将细胞进行分组，寻找不同细胞群体之间的差异和相似性。 同时，R语言还提供了多种数据可视化的方法，我们可以使用R语言中的绘图包如‘ggplot2’和‘pheatmap’等对单细胞测序数据进行可视化。可视化可以帮助我们更直观地展示细胞群体的分布情况、基因表达的模式等，从而更好地理解和解释实验结果。 总而言之，单细胞测序数据的R语言分析可以帮助我们深入理解细胞的表达特征和功能，发现新的细胞类型和亚群体，并为研究细胞发育、疾病机制等提供重要的生物学信息。

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