主成分分析——数据中心化与标准化处理

在主成分分析法中,一般来说,我们进行的第一步应该是对所有样本数据进行中心化,甚至是标准化处理。那么我们为什么要对样本数据进行中心化和标准化处理呢?
在一般的实际问题当中,我们要分析的数据一般是多个维度的,由多个特征或者属性构成的复杂数据集合。例如对某个地区的人均收入构建预测模型或者进行分析的时候,我们会考虑到该地区的GDP总量、人口数量、税收等,显然它们的单位或者说是数量级都是不一样的。我们通过中心化将各类数据整合在原点附近,使其统一起来便于后续处理。也可以进一步进行标准化处理,使得各类数据在每个维度上的取值范围都相同。
中心化的方法:
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上式中,x是原始样本数据,μ是样本期望,通过上述变换,我们得到期望是0的新的样本数据集。
标准化的方法:
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在中心化的基础上除以原始样本数据的标准差,我们得到期望是0,标准差是1的新的样本数据集。
以下分别为原始数据集、中心化数据集、标准化数据集的运行结果:
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通过对比可以发现,原始数据集离散程度比较大,数据集合并不是以原点为中心,而通过中心化处理后数据集合基本以原点为中心形成一个簇,再通过标准化处理后,数据集合在x和y两个维度上分布范围基本都落在[-2,2]区间之内。

进行PCA主成分分析之前,通常需要对原始数据进行标准化处理,以确保不同变量之间的尺度差异不会对分析结果产生影响。常用的数据标准化方法包括: 1. Z-Score标准化:将每个变量的值减去该变量的均值,再除以该变量的标准差这样可以使得每个变量的均值为0,标准差为1。 标准化公式:z = (x - mean) / std 2. Min-Max标准化:将每个变量的值通过线性变换映射到一个特定范围内,常见的是将值映射到[0, 1]或[-1, 1]之间。 标准化公式:x_scaled = (x - min) / (max - min) 3. Decimal Scaling标准化:将每个变量的值除以一个适当的因子,使得结果落在[-1, 1]之间。 标准化公式:x_scaled = x / 10^k 具体选择哪种标准化方法取决于数据的特点和分析目的。一般来说,Z-Score标准化是最常用和推荐的方法,因为它不依赖于数据的分布情况,并且能够保留原始数据的信息。 在Canoco 5中,进行PCA主成分分析时,可以通过以下步骤进行数据标准化处理: 1. 打开Canoco 5软件,导入待分析的数据集。 2. 在数据集中选择需要进行PCA的变量列。 3. 在数据预处理选项中选择合适的标准化方法,例如Z-Score标准化。 4. 运行PCA主成分分析,观察标准化后的结果。 需要注意的是,在进行PCA之前,应该对数据进行适当的缺失值处理和异常值处理,以确保标准化结果的准确性和可靠性。此外,还可以根据实际需求调整标准化方法和参数,以获得更好的分析结果。
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