差异分析的结果各种热图，火山图，箱式图可视化作图教程

0. 与该篇文章相关的前情回顾

0.1 OmicsTools的软件介绍下载获取

软件介绍

我开发了一款本地电脑无限使用的零代码生信数据分析作软图神器电脑软件OmicsTools，欢迎大家使用OmicsTools进行生物医学科研数据分析和作图，该软件件能让大家在不需要任何编程和代码编写的基础上，分析次数没有限制，可以无限使用，让您在自己的电脑上快速进行大量的生信分析和加速大家的科学研究。

软件下载

我开发的本地电脑无限使用无限分析作图的生信零代码一键分析电脑软件神器OmicsTools 软件在github上的zihaoxingstudy1/OmicsTools仓库中，大家可以下载安装OmicsTools进行各种生信分析和可视化作图。

更新的软件下载

OmicsTools软件是一直都在更新，而且是永久更新的，而且更新非常频繁，一直在为大家增加更多的生信分析功能，一般每隔两周都会更新一版OmicsTools并添加更多新的功能进来。

OmicsTools的更新和优化包括实时推送的日常小更新优化和版本整体的增量大更新，平时用户反馈参数的改动和新特性和一些问题我都会快速进行优化，用户只需要把软件进程关掉，重启一下，就能实时享受到最新的功能和解决掉反馈的故障问题，大版本的更新我每隔两周左右发一个新版本的安装包。

我更新的在本地电脑无限使用无限分析作图的生信零代码一键分析电脑软件神器OmicsTools新版本软件都可以到我的zihaoxingstudy1/OmicsTools github仓库中下载，也可以到我的生信交流qq群931846486的群文件中下载到OmicsTools分析软件,大家可以一直下载安装更新的OmicsTools软件进行各种生信分析和可视化作图。

获取OmicsTools的相关资料和激活码

OmicsTools的永久使用激活码和资料获取链接：https://s.click.taobao.com/aLV2set

OmicsTools的相关资源和永久会员永久终身使用的激活码获取  

(这是永久会员版，可在自己的电脑上终身永久使用，无限分析)

日常每天晚上11点左右会在b站’邢博士谈科教’直播间上给大家在线直播生信分析教学和答疑，大家平时有空的时候都可以来看我直播，跟我提问和学习生信分析快速做各种生物医学领域的科研

0.2 OmicsTools的安装使用和R语言分析环境的配置教程

教程地址： OmicsTools的R语言分析环境配置教程效果示意图-CSDN博客文章浏览阅读2k次，点赞25次，收藏37次。我开发了一款本地电脑无限使用的零代码生信数据分析作软图神器电脑软件OmicsTools，欢迎大家使用OmicsTools进行生物医学科研数据分析和作图，该软件件能让大家在不需要任何编程和代码编写的基础上，分析次数没有限制，可以无限使用，让您在自己的电脑上快速进行大量的生信分析和加速大家的科学研究。软件下载。_omicstoolshttps://blog.csdn.net/qq_40073899/article/details/139143993

0.3 GEO数据挖掘从数据下载处理质控到差异分析全流程分析步骤指南

教程地址： GEO数据挖掘从数据下载处理质控到差异分析全流程分析步骤指南-CSDN博客文章浏览阅读770次，点赞18次，收藏20次。大家看了我整个GEO分析流程的系统讲解视频+每个模块的实操讲解视频+每个模块的演示数据，这样下来基本上一天就能精通GEO的全流程分析，并能快速用自己的GEO测序数据或公共数据库下载的GEO数据在自己的电脑上跑完GEO分析的全部流程。包括但不限于GEO数据挖掘的全流程零代码一键分析软件神器OmicsTools在我的github仓库zihaoxingstudy1/OmicsTools仓库中大家可以下载安装进行各种生信分析和可视化作图。https://blog.csdn.net/qq_40073899/article/details/140425630 

1. 基因表达的热图绘制

1.1 根据所有差异基因绘制基因表达的聚类热图

视频教程: https://www.bilibili.com/video/BV13m421g7wv/

1.2 绘制top差异基因表达的聚类热图

视频教程: https://www.bilibili.com/video/BV1jZ42147KP/

1.3 绘制感兴趣基因的聚类热图

视频教程: https://www.bilibili.com/video/BV1jZ42147KP/

2. 差异分析结果的火山图绘制

2.1 高中低差异表达分类着色的火山图绘制

差异分析火山图可视化，func_color_type参数值为categorical可绘制高中低差异表达分类着色的火山图

该节教程: https://www.bilibili.com/video/BV1DJ4m177oB/

2.2 高中低差异表达渐变着色的火山图绘制

差异分析火山图可视化，func_color_type参数值为continuous可绘制高中低差异表达渐变着色的火山图

该节教程: https://www.bilibili.com/video/BV1DJ4m177oB/

结果路径和文件

结果图

2.3 在火山图中标记出一组感兴趣的基因

差异分析火山图可视化，func_mark_target_genes参数的值为：hsa-miR-155-5p;hsa-miR-34a-5p;hsa-miR-122b-3p，可以在火山图把这三个miRNA的名字单独标记展示出来

该节教程: https://www.bilibili.com/video/BV1DJ4m177oB/

2.4 对多个差异分析结果文件批量绘制火山图

该节教程:https://www.bilibili.com/video/BV13E421P7zx/

要批量绘制火山图的三个转录组差异分析结果文件列表

批量绘制出的三个火山图：

3. 一组感兴趣的基因的表达量展示和差异比较的可视化

3.1 一张图中绘制一组基因表达水平的箱式图

该节教程: https://www.bilibili.com/video/BV1tb421n7oX/

3.2 对一组基因每个基因单独绘制一张箱式图

3.3 一张图中绘制多个基因的试验vs对照的差异箱式图,手动输入一组基因

该节教程:https://www.bilibili.com/video/BV1tb421n7oX/

3.4 一张图中绘制多个基因的试验vs对照的差异箱式图,提供一个基因列表文件

该节教程:https://www.bilibili.com/video/BV1oZ421M7sL/

3.5单个基因的多类别的试验vs对照差异箱式图

该节教程:https://www.bilibili.com/video/BV15S411w7E8/