singularity利用cnvnator.def文件,构建cnvnator.sif 镜像

这篇博客介绍了如何通过创建Singularity定义文件.cnvnator.def,来下载CentOS镜像并安装CNVnator软件,最终构建SIF文件。步骤包括:创建定义文件,指定从Docker Hub获取基础镜像,安装软件及依赖,并设置环境变量。使用Singularity构建命令生成名为.cnvnator.sif的镜像文件。注意需要足够的权限和考虑网络环境及ROOT版本匹配问题。
摘要由CSDN通过智能技术生成

使用Singularity下载CentOS镜像、安装CNVnator软件,并构建SIF文件的过程可以通过创建一个Singularity定义文件来完成。这个定义文件会指导Singularity如何构建容器,包括从哪里获取基础镜像、安装所需软件及其依赖项,以及任何其他配置步骤。以下是一个简化的过程:

第一步:创建Singularity定义文件

你需要创建一个Singularity定义文件,比如命名为**cnvnator.def**,包含所有安装和配置步骤。这个文件看起来可能如下:

singularityCopy code
Bootstrap: docker
From: centos:7

%post
    # 安装依赖项
    yum update -y && yum install -y epel-release
    yum 
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