这一节主要记录高歌老师的提问和裴钢老师的思路解答(皆为大意概括),以及一些基础知识。
课程传送门:北大生信课 P69 12-2 裴钢教授关于研究背景的介绍
细胞信号传导
细胞/机体接收外界信号后作出反应。
信号传入细胞内会引起两种变化:
1、快速变化;
2、长期变化 →导致基因改变。
表观遗传学现象
DNA不改变的前提下,基因组表达的区别的现象。其变化一般有两种途径:**
1、DNA修饰(甲基化:碱基上接甲基基团);
2、细胞核组蛋白(histone)修饰
甲基化
对调控基因表达很重要,由DNA甲基化酶进行修饰
课题:甲基化修饰酶对甲基化的不同作用与细胞信号传导的关系
主要研究对象为甲基化酶3
Q:不同的甲基化是否来源于酶的不同功能?
研究思路:酶的氨基酸结构的改变与其功能的关系。
高歌老师提问:
Q1:实验生物学上如何确定特定功能对应的氨基酸位点?及其意义?
裴A:
使用理论推算和实验验证相结合的方法来确定其功能位点,在谈之某个氨基酸对蛋白质功能的影响时,可在实验中使其突变,或改变氨基酸含量,来对比观察和正常状态下的区别。
意义:
蛋白质是组成生物体细胞的框架;
蛋白质是细胞膜的重要组成;
蛋白质是信号传导分子之一;
细胞的代谢离不开蛋白质
基因的转录和表达离不开蛋白质
Q2:生信方法引入的作用?
裴A:给予研究一个“导向地图”
Q3:验证生信结论的方法?
裴A:利用生信获得某基因在不同物种上的表达,观察所研究蛋白在目标生物(模式生物)身上缺失后的改变(敲除法);观察蛋白表达量对表达的影响;观察跨物种蛋白替换的表达结果