pyscenic的分析和可视化总算是结束了。其实还有python版本的可视化,但是已经不想研究了,和R差不多,主要是对结果的解读。
除了之前的可视化,今天我们要讲的内容有:
1、rank形式的转录因子展示,有些文章中是这样,特异性TF展示更直观。
2、利用我们之前说过的网络图展示TF与靶基因!
3、差异TF的分析,这也许是今天这个帖子的重点内容吧,可以像转录组那样,或者GSVA,寻找不同组织间差异性TF,结果更有说服力!
效果如下:
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(TF与靶基因)