Linux系统与shell教程(1):有没有兴趣玩耍一下shell版俄罗斯方块?


作者:余涛
email:yutao@big.ac.cn
中国科学院大学

来,我要诱惑你

想要入门生信吗?
想要学习Linux系统吗?
想要花最少的时间学会一门编程语言?
想要写一个shell版俄罗斯方块?
想要把生信分析流程(WES、RNA-Seq、Chip-Seq、Metagenomics-Seq…)捆成一个软件,批量运行?


来吧,学点shell!
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当然,万丈高楼平地起,我会从Linux系统、常用命令和shell语法等基础讲起。废话不多说,首先看看什么是shell?shell能干嘛?学会shell你要付出多少时间?

温馨提醒:由于阅读人群基础不一,这里默认面向零基础的群体,因此有很多啰嗦的话,老司机们请自行跳过某些部分。(毕竟,在这个知识爆炸的时代,浪费别人的时间实在是不道德的事)

Linux系统与shell

在互联网+的时代,无论是开发端游、手游、操作系统的程序猿,还是做大数据分析、人工智能的工程师,更或者是像我们这种苦逼的生信猿,无一例外都要用到Linux操作系统。这个由被称为“大鼻子男孩”Linus Torvalds在1991年开发的类Unix操作系统,现在已经成了除微软以外应用最广的的操作系统,尤其是一些大公司,甚至连微软自己都用。 另外一个你想不到的是,我们所有Android系统手机也是基于Linux系统的。Linux系统自创建以来就以开源(open source)为宗旨,现在已经有很多发行版本,例如像CentOS、Ubuntu、Debian等,每个版本一般都有桌面版本和服务器版本。Linux系统与Windows系统差别最大的一点是它以命令行模式为主,美国大片里各种狂拽酷炫屌炸天的黑客攻击的镜头,就是在Linux系统上干的。
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安装属于你的Linux系统

每个人都可以轻松拥有一个Linux操作系统(当然前提是你得有电脑),如果你是苹果电脑,直接打开shell程序即可进入命令行模式,因为苹果电脑本身就是Unix系统;如果不是,推荐在Windows 系统上安装虚拟机,好用的虚拟机软件例如VirtualBox、VMware,安装方法如同安装QQ、微信一样,具体的过程可以参考兄弟连Linux视频教程

shell的功能

无论哪个发行版本,Linux操作系统的核心原理都是基于shell实现外层应用程序和内核以及硬件的通信,从而实现人对机器的控制。 可见shell的初衷是帮助用户和管理员更好的维护和管理操作系统,但其实shell对于通常的文本处理(例如某些表格、系统运维日志),甚至是某些数值运算都是友好的。因此,学好shell既能帮助你把Linux系统玩得很溜,又能帮助你快速、便捷地处理一些简单或者复杂的编程项目,一举两得,何乐而不为呢?总结shell的主要功能:

  • Linux系统管理和运维:例如批量增加/删除多个用户
  • 文本处理
  • 数值运算
  • 整合其他软件/语言,搭建流程

shell特点

  • 简单:shell可以分为交互,和非交互的使用方式。在交互式模式,shell从键盘接收输入,所键即所得;在非交互式模式,shell从文件中获取输入,即运行shell脚本。
  • 还是简单:在Linux系统使用中,你所用到的每个命令都可以为shell 脚本所用,可以说只要你了解一些系统常用命令和shell基本语法,然后就可以像搭积木一样组合成一个有用的脚本。 最低的学习成本,获得高效的编程体验。对于毫无编程经验的小白来说,实在是跟python一样入门编程语言的首选。
  • 方便:shell语法精炼、高效,单行代码让你搞定问题。
  • 强大:虽然简单,但shell支持数组、函数、变量截取以及其他软件/语言的调用,灵活而强大。

shell版本

shell作为一门语言,也如java、perl、python等语言拥有不同的版本。不同的shell版本,基本功能、语法大致相同,但有些语法细节、命令参数使用会因版本有小的差异,在学习的时候需要注意。否则,在多个版本的切换中,你的shell脚本可能暗藏一些bug。

常见的shell版本

  • sh:即Bourne shell,是最基础的shell。
  • bash :Bourne-Again SHell,在sh的基础上增加了一些特性,最常用的shell,后面都以它为例讲解。bash可以完全兼容sh,也就是说用sh语法的脚本不加修改可以在bash中执行,反过来却不行,bash的脚本在sh上运行容易报语法错误。这一点一定要注意。
  • csh(C shell):类C的语法
  • tcsh:csh的增强版
  • zsh:Mac系统上超级增强版shell,被称为“终极shell”功能更强大,但配置什么也更复杂。zsh在github上star已经快90k了,fork也快17k了,如果有大神想用,请移步zsh github

查看你系统默认用shell版本以及安装的所有shell版本

echo $SHELL #echo命令用于输出、打印,在脚本调试时很有用
/bin/bash   #可见我系统默认shell是bash

cat /etc/shells #cat用于查看文本
/bin/sh #可见我系统自带4种shell
/bin/bash
/bin/tcsh
/bin/csh

shell初体验

Hello Shell

按照惯例,我们在非交互模式下写一个学习每一门语言都会写的第一个脚本–打印Hello Shell(交互模式下直接在命令行提示符键入echo “Hello Shell!”)。

[Neptuneyt]$ vi helloShell.sh #用vi/vim新建一个名为helloShell.sh的脚本,vi (vim)是linux系统一个强大的文本编辑器
#!/bin/bash
echo "Hello Shell!" #按i输入左边内容,esc+shift+:+x保存退出
[Neptuneyt]$ bash helloShell.sh #执行脚本
Hello Shell!

shell版俄罗斯方块

为了增加大家的学习兴趣,特地找了一个俄罗斯方块游戏的shell脚本,希望大家在看了本系列教程后,也能看懂这个脚本如何work的,或者至少能写出一个生信流程。
(将Tetris.sh里的shell源码复制到你的Linux系统,$提示符后键入bash Tetris.sh
现在开启童年模式,愉快的去玩耍俄罗斯方块吧!)
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怎么学shell

如果说编程就是搭积木游戏,你可以参考下面的套路:

  • 知道每一块积木的用途
    对于shell来说,你需要尽可能熟悉Linux系统命令,常用的可能20多个,例如grep、sed、awk等。
  • 遵守积木搭建的游戏规则
    其实就是语法,包括变量和流程控制。不同变量存储不同类型的数据(字符串、数值、数组等),流程控制决定整体运行方向(循环或者判断分支)。变量怎么命名?循环是什么结构?
  • 优化搭好积木的结构
    结构上是不是能精简?代码是不是能复用(函数)?循环时间是不是能压缩。。。
  • 搭一万次积木
    神枪手都是子弹喂出来的,程序猿也是,结合实际需求,多练多写才是王道。(当然,某些天才是例外,人生来是为了创造语言的)

本次shell教程的讲解和源码在Github Shell-10-Lessons,欢迎大家star、fork、watch!

参考

Shell script wikipedia
Shell Scripting Tutorial

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