3DSlicer三维重建

安装:

https://blog.csdn.net/qq_38828274/article/details/105648190
旧版本链接:
https://slicer-packages.kitware.com/#collection/5f4474d0e1d8c75dfc70547e/folder/5f4474d0e1d8c75dfc705482

在我的电脑上是最新版本好用 ,别的都奇奇怪怪的用起来,比如无法导入文件等。
注意:所有的文件夹都要用英文。

一、导入 DCM 文件序列

DCM 文件通常是多个组成一个序列,要选择DCM的上上一个文件夹导入。
首先 打开3DSlicer

如果双击打不开可以右键以管理员身份运行该文件

这时,菜单栏 是 Welcome to slicer

然后 点击 load DICOM data
在这里插入图片描述
这时, 菜单栏是 DICOM
点击 import dicom files
在这里插入图片描述
如果之前导入过 右边将出现病人信息;
此时,弹出小窗口,选择dcm文件的上上一级文件夹 , 就是病人的文件夹
一次选中一个文件夹,点击import
在这里插入图片描述

此时 菜单栏是dicom
选中病人信息导入
在这里插入图片描述
关于右边的信息
在这里插入图片描述
我这里报错:因为我的版本是4.11不稳定,后面卸载了换成4.10就debug成功了。
在这里插入图片描述
换了新版本没问题了。
这是肺部三维重建的链接:

https://www.bilibili.com/video/BV1Bh411v74M/?spm_id_from=autoNext

导出STL:
(2)在modules处选择Segmentation模块
(3)进入segmentation模块,选择Operation——Export,Output Type——Models,点击Export按钮;
(4)选择Save,文件格式选择STL,选择保存路径即可得到STL文件。

在这里插入图片描述
保存的stl是灰色的。

在这里插入图片描述
https://zhuanlan.zhihu.com/p/150713463

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3D Slicer是一款开源的医学图像处理软件,它能够将医学图像转化成三维模型,并进行分析和可视化。其主要应用领域包括医学影像处理、脑神经科学、心血管疾病分析、手术规划等。 在医学影像处理的领域中,3D Slicer主要应用于医学图像重建,其主要流程包括图像导入、图像分割、三维重建等。通过图像导入,3D Slicer可以支持DICOM、NIfTI、ITK等多种图像格式,并支持多视图显示。在图像分割方面,3D Slicer可以利用多种算法进行分割,包括基于图论的分割、基于水平集的分割、基于区域生长的分割等。得到分割结果后,3D Slicer还可以进行三维重建,利用分割结果和算法生成精细的三维模型。 在脑神经科学领域中,3D Slicer主要应用于神经网络重建、功能性连接分析等。通过3D Slicer进行神经网络重建,可以将大量的神经纤维以三维形式呈现出来,并利用已知的神经元结构和信号传递方式,对神经网络进行分析和建模。同时,3D Slicer还可以利用功能磁共振成像(fMRI)数据进行功能性连接分析,揭示不同区域之间的联系和相互作用。 在心血管疾病分析和手术规划领域中,3D Slicer主要应用于心脏和血管的三维建模。利用3D Slicer提供的各种算法,可以对心脏和血管进行准确的分割,生成精细的三维模型,并进行可视化和分析。得到的模型可以为疾病诊断、手术规划和手术指导等提供关键的支持。 综上所述,3D Slicer是一款功能强大的医学图像处理软件,具有广泛的应用领域和实用的功能,成为了医学图像处理领域的重要工具之一。
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