【深度学习笔记】3D Slicer三维可视化

最新推荐文章于 2024-06-12 20:54:03 发布
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分类专栏： 【深度学习笔记】
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这篇博客介绍了如何使用3D Slicer进行深度学习结果的三维可视化，包括数据导入、区域分割显示、颜色定制、视角调整以及截图保存等操作。用户可以通过调整阈值和应用显示来呈现3D模型。
摘要由CSDN通过智能技术生成

导入数据,直接拖进来就行
在这里插入图片描述
分割后的区域与原始图片一起显示
在这里插入图片描述
单独显示肝脏并改变颜色
在这里插入图片描述
在这里插入图片描述
在这里插入图片描述
在这里插入图片描述

  1. 打开 Layout Selection 选择 3D only
  2. 调整角度，关闭 3D cube 和 3D axis 的显示
  3. 截图工具中保存图片
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专栏目录
Slicer学习笔记（五十四）slicer分割结果3D显示
juluwangriyue的博客
03-26 2218
Slicer学习笔记（五十四）slicer分割结果3D显示1、Create a segmentation from a labelmap volume and display in 3D2、Export labelmap node from segmentation node3、Export model nodes from segmentation node4、Create a hollow model from boundary of solid segment5、Show a segmentation
3D Slicer：从入门到精通（三）——用户界面概览
walt3433的博客
02-26 3296
Slicer将所有加载的数据存储在一个称为“场景”的数据仓库中（或称为Slicer场景或MRML场景）。场景中的每个数据集，如图像体积、表面模型或点集，都以“节点”的形式表示。 Slicer提供了大量的“模块”，每个模块实现了一组特定的功能，用于在场景中创建或操作数据。模块通常不直接相互作用：它们只是操作场景中的数据节点。Slicer包含超过100个内置模块，可以通过使用扩展管理器安装额外的模块。
三维医学图像可视化软件（3D Slicer！！一款超好用的多角度软件~~）支持3D可视化！！！
weixin_45325693的博客
07-18 777
三维医学图像可视化软件（3D Slicer！！一款超好用的多角度软件~~）支持3D可视化！！！
3D Slicer简单三维重建
weixin_44715117的博客
06-18 1万+
前言 本文章使用3D Slicer对输入数据进行三维重建，结合别人的经验以及自己的摸索，写成这一篇文章，只是简单的记录一下自己做过的事情，并没有多少深入的去研究，对一些东西可能理解的不够好，希望读这篇文章的人能够谅解，不喜勿喷。 参考资料 CT图片三维重建方法之3DSlicer篇 临床影像实践 B站视频–血肿及中线测量 补充说明 获取切片的间距，这里我用的是python的代码来实现的，所用的图片是使用LITS数据集由NII文件转为png图片来实现的，NII转PNG图片在我的博客另外一篇文章里面有，这里获取切
3D slicer 进行三维可视化
BLvren_的博客
06-21 5947
Volume Rendering Module 图像加载完成后，初始只显示3个正交切面（MPR）视图。为了便于观察，增加显示体绘制（Volume Rendering）视图
3DSlicer三维重建
qq_43507388的博客
04-30 4993
三维重建
3D Slicer使用与体绘制
Spirite_hunter的博客
11-23 720
3D Slicer默认不进行体绘制，右上角的三维重建窗口只显示一个空的立方体框。在体绘制设置窗口中，选择进行体绘制的DICOM序列，然后将体绘制开关打开（眼睛标志）
3D Slicer的学习（二） 图像的分割
最新发布
tuweibazong的博客
06-12 1147
先对不同层级标注，然后点击Fill between slices -> Initialize -> Apply拖动层级颜色区域就会变成连续自适应的动态变化区域。如图，点击Level tracing，在图像上放置鼠标，会显示可能想要选中区域的轮廓，点击鼠标右键会将其显示为蓝色。然后点击Grow from seeds -> Initialize -> Apply，显示3D之后会自动扩展到其他位置的相同部位，从而展示整个部位。如图为copy之后，将黄色区域的颜色复制到原本的绿色区域。
超级简单的3D slicer使用教程（一）
wacebb的博客
05-05 3万+
接触此软件的对他应该是有几个基本了解了，话不多说，直接来介绍用法吧。 1.界面基本介绍 一打开界面应该是这个样子： 这是外国人开发的软件，所以是英文界面也没有什么疑问，而且这软件多用与医学领域，所以也不是特别热门，所以也暂时没有汉化，所以对于一些英文不是特别好的同学还是有点困难的，但是只要认识一些基本词汇，比如model这些，使用此软件还是没什么问题的。 首先就是基本的操作界面，或者我...
3D Slicer 的帮助文档，中文教程
04-20
3D Slicer是一款广泛应用于生物医学工程领域的开源软件，它允许用户通过医学影像进行三维模型的提取。这个软件因其强大的图像处理和分析功能而在行业内受到推崇。以下是关于3D Slicer的一些关键知识点： 1. **系统...
Slicer-4.8.1-win-amd64.exe
05-16
3D Slicer是用于医学图像信息学，图像处理和三维可视化的开源软件平台。
Lambar_Spine_Slicer:腰椎影像智能分割可视化系统，采用Vue+Django框架，3DUNet算法自动分割nii医疗影像文件，并且可以在前端生成分割后的部位三维建模的模型
05-17
腰椎影像智能分割可视化系统，采用Vue+Django框架，3DUNet算法自动分割nii医疗影像文件，并且可以在前端生成分割后的部位三维建模的模型。 框架 在pycharm中运行Djsngo文件即可 前端代码在Vue中修改，默认8888端口 ...
3DSlicer入门操作教程
luemeon的博客
09-16 1万+
3DSlicer用于医学图像
3Dslicer学习(1)--Slicer welcome Tutorial
bslh123000的博客
05-22 3090
本学习教程是根据官方网站教程一步步来的。一.安装自己参考其他博客，这里就不再介绍了。二.一些基本操作的解释：1.有4个视图，其中一个是3D视图，其他三个分别是矢状，冠状，横截面三个方向的片子。对于三个方向的视图来说，每个上面的横条是选择位置的。如：当我移动黄色上的条时：可以清楚的看到位置变化了，因此拉条就是为了确定位置用的。2.如果想移动3D视图里的位置，就按住shift然后加鼠标去移动。如果想旋...
【3D Slicer】心脏CT图像分割操作保姆级教程 Cardiac CT image segmentation
xzrrr的博客
03-04 1684
它可以帮助用户自动生成插值切片，填补图像中切片之间的空隙或缺失。2.保存MRB文件（医疗现实束）：Medical Reality Bundle（.mrb）3.保存Volume（体数据）：格式可为nrrd、nii、nii.gz、img等。1.保存MRML文件（场景文件）：MRML Scene（.mrml）如果打错了标签，得先按Enter键保存，再按Ctrl+Z键才能撤回。每打完一个标签，按Enter键保存。(3)右心室血腔(RV)(4)右心房血腔(RA)(5)左心室血腔(LV)(6)左心房血腔(LA)
使用3d Slicer标注病灶并生成ROI掩膜
Su_Del的博客
02-03 8164
本篇博客给大家演示一下如何使用3d Slicer标注病灶并生成ROI掩膜，供深度学习模型训练使用。 关于3d Slicer和MRIcron的安装请看我的另一个帖子。 一、数据加载 你可以使用你手头的数据进行标注，这里为了示例方便，我是用的3d Slicer中给出的Sample Data中的MRBrainTumor1的数据。 二、病灶标注及保存 Modules选择Segment Editor： 然后点击Add按钮添加一个Segment，在下方便签上双击可以修改Segment的命名和颜色等。下方三个按钮
3D Slicer 制作个性化面具并导出保存为3D打印文件
learner_jj的博客
04-17 1075
采用3D slicer 基于结构像制作个性化面具
3Dslicer1:入门及基本控制
热门推荐
沈春旭的博客
07-30 3万+
1.用户环境 模块面板：显示模块界面，Slicer中功能通过模块化的方式实现；切片窗口：显示三个切片分量，冠状面R、矢状面Y、水平面G；数据探针：用于显示鼠标在切片视图中移动时的实时坐标信息。 1.1 系统主菜单 1.File-文件管理功能 Add Data：添加Slicer数据，可以是一般的Slicer场景；DICOM：添加DCM数据文
3d slicer三维重建dcm数据
05-14
3D Slicer是一款免费的开源软件，可用于创建和处理医学图像数据。它支持多种图像格式，包括DICOM格式，可以使用DICOM数据进行三维重建。 使用3D Slicer进行三维重建需要以下步骤： 1. 导入DICOM数据：选择菜单“加载数据”并选择数据文件夹。3D Slicer将加载DICOM文件并将它们显示在“数据”面板中。 2. 创建三维模型：选择“模块”→“重建和可视化”→“三维可视化”。在“三维场景”面板中，选择“添加”→“模型”。输入名称并选择要创建的模型类型。选择适当的参数并单击“应用”。 3. 加载模型：在“三维场景”面板中，选择“添加”→“模型”。在弹出的窗口中选择要加载的模型。单击“确定”。 4. 可视化模型：选择“三维场景”→“调整视图”。在“常规”选项卡中，可以选择适当的视图设置。选择“修改属性”选项卡以更改模型的外观和行为。 3D Slicer还提供了一系列功能，如分割、配准、测量和分析，可用于更精细的操作。它是一个强大的工具，可用于医学图像数据的处理和可视化。
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