【深度学习笔记】3D Slicer三维可视化

最新推荐文章于 2025-04-16 09:00:00 发布
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分类专栏： 【深度学习笔记】
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这篇博客介绍了如何使用3D Slicer进行深度学习结果的三维可视化，包括数据导入、区域分割显示、颜色定制、视角调整以及截图保存等操作。用户可以通过调整阈值和应用显示来呈现3D模型。

摘要生成于 C知道 ，由 DeepSeek-R1 满血版支持， 前往体验 >

导入数据,直接拖进来就行
在这里插入图片描述
分割后的区域与原始图片一起显示
在这里插入图片描述
单独显示肝脏并改变颜色
在这里插入图片描述
在这里插入图片描述
在这里插入图片描述
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  1. 打开 Layout Selection 选择 3D only
  2. 调整角度，关闭 3D cube 和 3D axis 的显示
  3. 截图工具中保存图片
最低0.47元/天 解锁文章
Slicer学习笔记（五十四）slicer分割结果3D显示
juluwangriyue的博客
03-26 2709
Slicer学习笔记（五十四）slicer分割结果3D显示1、Create a segmentation from a labelmap volume and display in 3D2、Export labelmap node from segmentation node3、Export model nodes from segmentation node4、Create a hollow model from boundary of solid segment5、Show a segmentation
Slicer学习笔记（三十九）slicer中Markups模块
juluwangriyue的博客
01-14 702
Slicer学习笔记（三十九）slicer中Markups模块1、概念1.1、Markups模块简介1.2、应用方向1.3、界面面板1.Markups List2.Buttons And Checkboxes3.Markups Table4.Advanced: Buttons、Naming、Conversion5.Advanced: Display Properties6.Advanced: Display Properties: Fiducuial Projection2、python开发3、C++开发
三维医学图像可视化软件（3D Slicer！！一款超好用的多角度软件~~）支持3D可视化！！！
weixin_45325693的博客
07-18 1032
三维医学图像可视化软件（3D Slicer！！一款超好用的多角度软件~~）支持3D可视化！！！
3D Slicer简单三维重建
weixin_44715117的博客
06-18 1万+
前言 本文章使用3D Slicer对输入数据进行三维重建，结合别人的经验以及自己的摸索，写成这一篇文章，只是简单的记录一下自己做过的事情，并没有多少深入的去研究，对一些东西可能理解的不够好，希望读这篇文章的人能够谅解，不喜勿喷。 参考资料 CT图片三维重建方法之3DSlicer篇 临床影像实践 B站视频–血肿及中线测量 补充说明 获取切片的间距，这里我用的是python的代码来实现的，所用的图片是使用LITS数据集由NII文件转为png图片来实现的，NII转PNG图片在我的博客另外一篇文章里面有，这里获取切
医学图像可视化工具介绍（一）-3D Slicer
最新发布
weixin_52145255的博客
04-16 915
3D Slicer 是一个免费的开源软件平台，用于医学、生物医学和其他 3D 图像的可视化、处理、分割、配准和分析。Slicer 的功能包括：（1）读/写DICOM图像和多种其他格式；（2）三维图像、多边形网格和体积渲染的交互式可视化；（3）手动编辑和标记图像；（4）使用刚性和非刚性算法融合和共同配准数据；（5）图像自动分割；（6）跟踪图像引导程序的设备。3D Slicer可以高效的帮助用户可视化各种类型的医学图像。安装打开后可以看到主页面如下。更多信息可以参考。
3D slicer 进行三维可视化
BLvren_的博客
06-21 7901
Volume Rendering Module 图像加载完成后，初始只显示3个正交切面（MPR）视图。为了便于观察，增加显示体绘制（Volume Rendering）视图
3D Slicer的学习（二） 图像的分割
tuweibazong的博客
06-12 3363
先对不同层级标注，然后点击Fill between slices -> Initialize -> Apply拖动层级颜色区域就会变成连续自适应的动态变化区域。如图，点击Level tracing，在图像上放置鼠标，会显示可能想要选中区域的轮廓，点击鼠标右键会将其显示为蓝色。然后点击Grow from seeds -> Initialize -> Apply，显示3D之后会自动扩展到其他位置的相同部位，从而展示整个部位。如图为copy之后，将黄色区域的颜色复制到原本的绿色区域。
3D Slicer 教程五 ---- 基本功能介绍(二)
smallITperson的博客
10-18 1131
接上篇。
3DSlicer三维重建
qq_43507388的博客
04-30 6070
三维重建
3D Slicer中文教程（五）—三维视图颜色改变
weixin_33768481的博客
11-03 2934
3D Slicer在分割后三维重建的图像，效果很好，但是存在一定的不足，默认的颜色并不是很合适，这时手动设置三维视图下的需要的颜色就很有必要了。如下图所示，默认的三维重建后的颜色。 这样的颜色显然不是颅骨正常的颜色，需要设置颜色，设置步骤如下： （1）模块选择窗口——Segment Editor （2）点击图中1位置Logical Operators，点击2位置的颜色块 （3...
3D Slicer：从入门到精通（三）——用户界面概览
walt3433的博客
02-26 4934
Slicer将所有加载的数据存储在一个称为“场景”的数据仓库中（或称为Slicer场景或MRML场景）。场景中的每个数据集，如图像体积、表面模型或点集，都以“节点”的形式表示。 Slicer提供了大量的“模块”，每个模块实现了一组特定的功能，用于在场景中创建或操作数据。模块通常不直接相互作用：它们只是操作场景中的数据节点。Slicer包含超过100个内置模块，可以通过使用扩展管理器安装额外的模块。
Slicer-4.8.1-win-amd64.exe
05-16
3D Slicer是用于医学图像信息学，图像处理和三维可视化的开源软件平台。
Jupyter笔记本中运行3D Slicer扩展的全新体验
它支持多种医学和非医学数据，并且拥有一个可视化的用户界面，便于用户进行图像分割、配准、可视化以及三维重建等多种操作。3D Slicer广泛应用于生物医学工程、放射学、计算神经科学等领域。 ### SlicerJupyter扩展...
3D Slicer-强大的开源医学图像分割工具概述
仰望星空的博客
07-12 1408
所有的功能模块可在工具栏里找到，提供搜索，下拉选择，左右切换等功能。功能模块概览欢迎模块“欢迎”模块 — 3D Slicer 的主页data模块充当中央数据组织中心。列出当前场景中的所有数据，并允许搜索、重命名、删除和移动等基本操作。DICOM模块导入和导出 DICOM 对象，例如图像、分割、结构集、放射治疗对象等。volumes模块用于更改三维数据的展示外观。与体渲染模块不同，不会渲染数据的 3D 表示。但是会更改2D 切片视图中的视觉外观（如窗宽窗位的调整）。
3D Slicer使用与体绘制
Spirite_hunter的博客
11-23 1271
3D Slicer默认不进行体绘制，右上角的三维重建窗口只显示一个空的立方体框。在体绘制设置窗口中，选择进行体绘制的DICOM序列，然后将体绘制开关打开（眼睛标志）
超级简单的3D slicer使用教程（一）
热门推荐
wacebb的博客
05-05 3万+
接触此软件的对他应该是有几个基本了解了，话不多说，直接来介绍用法吧。 1.界面基本介绍 一打开界面应该是这个样子： 这是外国人开发的软件，所以是英文界面也没有什么疑问，而且这软件多用与医学领域，所以也不是特别热门，所以也暂时没有汉化，所以对于一些英文不是特别好的同学还是有点困难的，但是只要认识一些基本词汇，比如model这些，使用此软件还是没什么问题的。 首先就是基本的操作界面，或者我...
3DSlicer使用指南——冠脉分割
m0_73719342的博客
11-18 3100
该步骤可以在apply之后观看三维视图，阈值不合适可以再次调整至合适为止）在三个视图中分别圈出心包的位置（注意多圈一些以免血管可能漏，鼠标右键退出圈点功能）如下图所示，可以在三维视图中对圈的范围进行调整。解决方法1：在标注之前先remove掉三维图像中的小噪点，显卡计算量减小，卡顿减轻。点击此按钮调整图像对比度（关闭标签1视图，鼠标左键上下滑动调整至合适对比度即可）在三维视图中拖拉球刷对冠脉进行标注（shift+鼠标滚轮调整球刷大小）通过三维图像观察冠脉断点，在二维图像中进行补全。
3DSlicer入门操作教程
luemeon的博客
09-16 2万+
3DSlicer用于医学图像
【3D Slicer】心脏CT图像分割操作保姆级教程 Cardiac CT image segmentation
xzrrr的博客
03-04 2809
它可以帮助用户自动生成插值切片，填补图像中切片之间的空隙或缺失。2.保存MRB文件（医疗现实束）：Medical Reality Bundle（.mrb）3.保存Volume（体数据）：格式可为nrrd、nii、nii.gz、img等。1.保存MRML文件（场景文件）：MRML Scene（.mrml）如果打错了标签，得先按Enter键保存，再按Ctrl+Z键才能撤回。每打完一个标签，按Enter键保存。(3)右心室血腔(RV)(4)右心房血腔(RA)(5)左心室血腔(LV)(6)左心房血腔(LA)
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