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本文介绍了如何使用Materials Studio结合Moltemplate快速构建OPLSAA力场参数的分子模型。首先在MS中绘制分子结构，然后设置原子力场，接着转换为Lammps Data文件，再利用Moltemplate生成LT文件，并引入力场运行Moltemplate，最终生成力场文件。
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主要专栏内容包括：
†《LAMMPS小技巧》：
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†《LAMMPS小技巧》： 主要介绍采用分子动力学（
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Lammps
Lammps）模拟相关安装教程、原理以及模拟小技巧（难度：
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††《LAMMPS实例教程—In文件详解》：
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††《LAMMPS实例教程—In文件详解》： 主要介绍采用分子动力学（
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Lammps
Lammps）模拟相关物理过程模拟。（包含：热导率计算、定压比热容计算，难度：
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†††《Lammps编程技巧及后处理程序技巧》：
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\textbf{ \underline{\dag\dag\dag《Lammps编程技巧及后处理程序技巧》：}}
†††《Lammps编程技巧及后处理程序技巧》： 主要介绍针对分子模拟的动力学过程（轨迹文件）进行后相关的处理分析（需要一定编程能力。难度：
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††††《分子动力学后处理集成函数—Matlab》：
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\textbf{ \underline{\dag\dag\dag\dag《分子动力学后处理集成函数—Matlab》：}}
††††《分子动力学后处理集成函数—Matlab》： 主要介绍针对后处理过程中指定函数，进行包装，方便使用者直接调用（需要一定编程能力，难度：
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★）。
†††††《SCI论文绘图—Python绘图常用模板及技巧》：
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\textbf{ \underline{\dag\dag\dag\dag\dag《SCI论文绘图—Python绘图常用模板及技巧》：}}
†††††《SCI论文绘图—Python绘图常用模板及技巧》： 主要介绍针对处理后的数据可视化，并提供对应的绘图模板（需要一定编程能力，难度：
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★）。
††††††《分子模拟—Ovito渲染案例教程》：
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\textbf{ \underline{\dag\dag\dag\dag\dag\dag《分子模拟—Ovito渲染案例教程》：}}
††††††《分子模拟—Ovito渲染案例教程》： 主要采用
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\rm Ovito
Ovito软件，对
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\rm Lammps
Lammps 生成的轨迹文件进行渲染（难度：
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\rm lammps\_materials@163.com
lammps_materials@163.com
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建模篇（上）：OPLSAA力场参数之快速建模—MS+Moltemplate
建模篇（下）力场快速设置-AoToFF+Moltemplate
MS+Moltemplate
本文介绍采用 M a t e r i a l s S t u d i o \rm Materials\ Studio Materials Studio的建模方法构建单体分子，采用 M o l t e m p l a t e \rm Moltemplate Moltemplate 进行阵列构成结构。
一、MS中画出分子结构
在MS中画出自己需要的分子结构。当然也可以从其他渠道获得PDB文件，读取到MS中。
二、根据OPLSAA力场文件设置原子力场
1. OPLSAA力场
我们可以看到OPLSAA力场文件中，每一种原子对应以数字为编号的TYPE。我们根据自己的原子结构找到对应的TYPE编号。
OPLSAA文件下载
链接：请点击
提取码：1x9o
2. 根据OPLSAA力场中的原子质量进行检查
3. 在MS中设置为对应的原子编号
三、转换为Lammps可以读取的Data文件
这里采用Lammps目录下的小程序： . / l a m m p s / t o o l s / m s i 2 l m p . e x e \rm ./lammps/tools/msi2lmp.exe ./lammps/tools/msi2lmp.exe
根据手册执行命令，这里不再赘述 （注意，测试的data文件为
t
e
s
t
.
d
a
t
a
\rm test.data
test.data）
四、采用Moltemplate自带工具生成Lt文件
1. 生成LT文件
手册中
P
64
P64
P64 页给出了详细介绍
所以这里我们直接运行就行：（再次注意这里的只需要我们刚才生成的
t
e
s
t
.
d
a
t
a
\rm test.data
test.data 文件）
2. LT文件结构
运行后生成 对应的
L
T
\rm LT
LT 文件：
M
o
l
.
l
t
\rm Mol.lt
Mol.lt
五、引入OPLSAA力场并运行Moltemplate
1. 运行Moltemplate
Moltemplate.sh system.lt
2. 生成对应的力场文件
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