lammps建模(电解液)opls-aa力场的基本流程

1.Gaussian 优化结构 可参考相应的文献。

2.LigParGen Server/等一些在线网址生成相应的力场文件lmp,gro itp等。

3.文件的转换参考:Molecular Force Field for Ionic Liquids V: Hydroxyethylimidazolium, Dimethoxy-2- Methylimidazolium, and Fluoroalkylimidazolium Cations and Bis(Fluorosulfonyl)Amide, Perfluoroalkanesulfonylamide, and Fluoroalkylfluorophosphate Anions | The Journal of Physical Chemistry B

    GitHub - paduagroup/clandp: Force field for ionic liquids参考问文件中il.ff文件的书写格式,共分五项:一定要单位统一

    1.ATOMS
    #     typ  m/u     q/e    pot   pars
    # dialkylimidazolium JPCB 108 (2004) 2038
    C1    CT  12.011  -0.17   lj    3.50   0.27614

    2.BONDS
    # i j    pot    re/A    kr/kJmol-1
    # alkanes OPLS-AA JACS118(1996)11225, JPC100(1996)18010
    HC  CT   cons   1.090   2845.0
    CT  CT   harm   1.529   2242.0

    3.ANGLES
    # i j   k    pot    th/deg  ka/kjmol-1
    # alkyl OPLS-AA JACS118(1996)11225, JPC100(1996)18010
    CT  CT  CT   harm   112.7   488.3
    CT  CT  HC   harm   110.7   313.8 
    HC  CT  HC   harm   107.8   276.1

    4.DIHEDRALS
    # i j   k   l    pot    v1        v2        v3        v4
    # alkanes OPLS-AA JACS 118 (1996) 11225; JPC 100 (1996) 18010
    HC  CT  CT  HC   opls   0.0000    0.0000    1.2552    0.0000
    CT  CT  CT  HC   opls   0.0000    0.0000    1.2552    0.0000
    CT  CT  CT  CT   opls   5.4392 &n

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