win10+anaconda+python3.8虚拟环境中openslide包的安装全记录

提示：文章写完后，目录可以自动生成，如何生成可参考右边的帮助文档

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前言

openslide是利用python处理医学领域内WSI的包，以下是在windows10上创建虚拟环境时在虚拟环境内安装openslide包的记录。

提示：以下是本篇文章正文内容，下面案例可供参考

一、创建环境

利用conda create 即可，此处不再详述。
注意：博主使用的python 3.8，下述方法可以在该版本的python上成功解决，未尝试其他版本是否有效。

二、安装openslide

1.下载openslide二进制文件

下载地址：https://openslide.org/download/#windows-binaries

选择最新版本即可。

2.环境变量配置

将openslide安装包放到自己Anaconda的虚拟环境中解压即可：

配置环境变量：
将openslide安装包的bin、lib所在路径添加到系统环境变量path
中

3、pip安装

打开Anaconda Prompt,pip install openslide-python即可，显示安装成功即可。

4、修改lowlevel.py文件

打开虚拟环境对应的文件夹下的openslide文件夹找到lowlevel.py：

修改为：

请注意：
1、可先尝试在文件夹中添加import os后面添加注释掉的两行，有些可以成功。
2、若1不成功，则尝试在if platform.system() == ‘Windows’: 下添加os.environ[‘PATH’] = “openslide-win64-20171122-bin的路径” + “;”+ os.environ[‘PATH’]，看此时是否成功。
3、若此时报错如下：

FileNotFoundError: Could not find module ‘libopenslide-0.dll’ (or one of its dependencies). Try using the full path with constructor syntax.

具体错误原因可能是因为加载.dll文件时出了问题，即该句代码：
_lib = cdll.LoadLibrary(‘libopenslide-0.dll’)
将此行注释掉，替换为：
_lib = cdll.LoadLibrary(find_library(“libopenslide-0.dll”))
保存lowlevel.py，尝试是否成功：

NameError: name ‘find_library’ is not defined

find_library函数未定义
经查找，得知该函数时ctypes.util库里面的函数，故在文件开头应导入该库和该函数：

如果仍然报错，windows分支下该行代码则进行如下调整：
_lib = cdll.LoadLibrary(‘libopenslide-0.dll’)
将里面的文件名改成其完整的路径：
_lib = cdll.LoadLibrary(‘D:\Anaconda\envs\gx_ten\Library\openslide-win64-20171122\bin\libopenslide-0.dll’)

至此，保存lowlevel.py，尝试是否成功：

大功告成！

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总结

上述就是openslide安装的全过程，答主还没有在pycharm里面试过，希望我的env不要崩哇，球球了。记录以下，提醒之后的自己~