今天画图时发现这个我无法设置seaborn的图片大小,情形如下
import scanpy as sc
adata=sc.read("/Users/xiaokangyu/Desktop/test_dataset/bct/bct_raw.h5ad")
adata
结果如下
当我设置图片大小时
可以看到,这个图片的大小根本不发生变化
解决办法1
import seaborn as sns
import matplotlib.pyplot as plt
# overview the distribution of cluster after init clustering
ax=sns.catplot(x="cell.class", kind="count", palette="ch:.25",data=adata.obs)
ax.set(ylabel='number of cells')
ax.figure.set_size_inches(12,6)
plt.show()
结果如下
但是我在服务器上会报错,可能是seaborn的版本问题
解决办法2
#height=8.27, aspect=11.7/8.27
import seaborn as sns
import matplotlib.pyplot as plt
# overview the distribution of cluster after init clustering
ax=sns.catplot(x="cell.class", kind="count", palette="ch:.25",height=6,aspect=2,data=adata.obs)
ax.set(ylabel='number of cells')
plt.show()
plt.show()
结果如下