splatter介绍
Splat模拟使用分层概率,其中从适当的统计分布生成数据集的不同方面。第一阶段产生每个基因的平均表达水平。这些最初是从Gamma分布中选择的。对于一些被选为高表达量的异常值的基因,从对数正态分布中产生一个因子。然后将这些因子乘以基因平均数的中位数,从而为这些基因创造新的均值。
每个基因的平均表达用过γ模拟;每个细胞计数用泊松分布采样。修改表达的离群值并且强制采用均值-方差趋势
splatter安装
从Bioconductor安装到:
if (!requireNamespace("BiocManager", quietly=TRUE))
install.packages("BiocManager")
BiocManager::install("splatter")
如果没有安装成功
执行
BiocManager::install("splatter",,force = TRUE)
然后,在packages中搜索,看是否成功安装
如果显示上图,则安装成功!!