记录一下在安装clusterProfiler包过程中遇到的问题
安装环境:R 4.1.0
过程记录:
- 利用Bioconductor安装
if (!requireNamespace("BiocManager", quietly = TRUE)) install.packages("BiocManager")
BiocManager::install("clusterProfiler")
library(clusterProfiler)
- 根据提示手动安装缺失的相关依赖包
- 加载成功之后利用(.packages())检查已安装并加载的包
总结:
1.利用Bioconductor安装相关R包,BiocManager::install("")
2.提示网络连接问题,有时是镜像选择问题
3.依赖包较多的情况下,不能一次安装成功,根据提示手动安装缺的包