clusterprofiler的安装问题

璇玑779

已于 2023-11-06 13:02:55 修改

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文章标签： java 前端服务器 r语言

于 2023-11-06 12:57:12 首次发布

本文链接：https://blog.csdn.net/qq_56429571/article/details/134243788

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问题：

library(clusterProfiler)

错误: package or namespace load failed for ‘clusterProfiler’ in loadNamespace(j <- i[[1L]], c(lib.loc, .libPaths()), versionCheck = vI[[j]]):

不存在叫‘HDO.db’这个名字的程辑包

BiocManager::install("HPO.db",force = TRUE)

下载的程序包在

‘C:\Users\ASER\AppData\Local\Temp\RtmpqQWI39\downloaded_packages’里

Warning message:

In install.packages(...) : 安装程序包‘HPO.db’时退出狀態的值不是0

解决方法：

通过百度网盘分享的文件：HPO.db_M…
链接:https://pan.baidu.com/s/1pM1mY9RoogCogzDdnYy3Ww
提取码:a546
复制这段内容打开「百度网盘APP 即可获取」

点击下载zip

将zip解压到D:\R-4.3.2\library下

之后

install.packages("D:\\R-4.3.2\\library\\HPO.db_MPO.db-main\\HPO.db_0.99.0.tar.gz", repos = NULL, type = "source")

install.packages("D:\\R-4.3.2\\library\\HPO.db_MPO.db-main\\MPO.db_0.99.0.tar.gz", repos = NULL, type = "source")

library(HPO.db)

library(clusterProfiler)

这样就安装好了

如果出现

错误: package or namespace load failed for ‘clusterProfiler’ in loadNamespace(j <- i[[1L]], c(lib.loc, .libPaths()), versionCheck = vI[[j]]):

不存在叫‘HDO.db’这个名字的程辑包

BiocManager::install("HDO.db",force = TRUE)

安装一下就好了

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