Ubuntu下使用conda安装homer并对感兴趣基因集进行转录因子预测分析

最新推荐文章于 2025-03-27 16:20:40 发布

Linenxulab

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文章标签： ubuntu conda linux

本文链接：https://blog.csdn.net/qq_61049648/article/details/125636988

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1.下载miniconda3并安装。

###下载
wget https://repo.anaconda.com/miniconda/Miniconda3-latest-Linux-x86_64.sh

###安装
bash Miniconda3-latest-Linux-x86_64.sh

一路点击yes，安装完毕。

2.配置环境变量。

vim ~/.bashrc ###进入编辑模式，按↓键到达最底端。

按“A”进入Inset模式。输入export PATH=/home/linan/miniconda3/bin:$PATH

按ESC :qw! Enter 退出编辑模式。

source ~/.bashrc ###永久保存并加载环境变量

3.安装Homer

conda list查看软件列表有无Homer。

有的话，conda install homer直接安装。

没有的话，两种选择，第一种使用conda install -c bioconda homer安装。第二种更新conda，使用conda update --all，更新完后再看下有无homer。

4.配置homer环境变量。

查看homer位置。输入which homer&#x

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ubuntu安装Miniconda并举例使用

总要有点可以骄傲的东西

10-11

3045

更新系统包官网下载Miniconda，最好是实体机下载后放进虚拟机，方法可以参考进入安装目录执行，右键进入终端执行，默认安装在主目录下bash Miniconda3-latest-Linux-x86_64.sh //你下载的文件名字，但是一定是sh结尾一直输入yes验证~/表示home目录下隐藏文件.bashrc当前目录：Downloads下conda deactivate 是一个用于退出当前激活的 Conda 环境的命令。

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