【Skmer—debug】

skmer 安装源： miniconda3

skmer之前跑过，没有出现过问题，但是这两天跑的时候会出现报错：

CalledProcessError:Command '['mash','dist','/home/work/xu_project/02.skmer/pdel_5x.msh','library/pte_5x/pte_5x.msh']' returned non-zero exit status 1.

【Debug过程】

1.上网搜索没有找到有效解决方案，应该是python内的问题。

2.首先以为是文件名的问题，更改后依然报错

3.接着改变了参数，改变K值进行测试，依然报错

4.用pal、pil、ppr三组数据进行测试，无报错，怀疑是数据本身的问题，经过几次排除后基本确定是pdel.5x.fq这一数据有问题，可能是数据格式不对或者是权限不对。重新cat和解压这组数据，问题解决。