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医学图像配准
文章平均质量分 91
主要介绍 Elastix 图像配准的原理、源码、参数文件、项目实战(2D与3D图像配准、点集配准)、可视化配准工具。
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【细胞分割 + 图谱配准】论文综述
分享几篇顶会/顶刊论文,解析方法和效果。原创 2024-06-17 20:56:58 · 76 阅读 · 0 评论 -
艾伦脑图谱(Allen Brain Atlas)
艾伦脑图谱(Allen Brain Map):由艾伦脑科学研究所(Allen Institute for Brain Science)开发的大脑图谱,目前已生成多个 艾伦大脑参考地图集(Allen Brain Reference Atlases)。原创 2024-06-17 20:53:43 · 171 阅读 · 0 评论 -
DeepSlice:基于深度卷积神经网络的图像配准
DeepSlice: 快速全自动配准小鼠脑成像到体积图谱原创 2024-02-04 10:29:15 · 957 阅读 · 2 评论 -
(7)医学图像配准综述:SimpleITK + SimpleElastix + Elastix + ITKElastix + PyElastix
常见的图像配准工具包括、SimpleITK、SimpleElastix、Elastix、ITKElastix和PyElastix。这些工具提供了强大的图像配准功能,支持医学、生物学等领域的图像处理和分析,为研究和临床应用提供了重要支持。原创 2024-02-04 10:12:42 · 1316 阅读 · 0 评论 -
(6)Elastix图像配准:可视化配准工具
主要介绍了三个可视化配准工具:(1)elastix-napari:基于napari的Elastix图像配准(2)SlicerElastix:基于3D slice的Elastix图像配准(3)BIRDS:基于ImageJ的Elastix双通道图像配准原创 2024-01-30 14:28:07 · 1062 阅读 · 0 评论 -
(5)Elastix图像配准:点集配准(局部区域的精度微调)
图像配准:基于固定图像和移动图像的相关特征进行度量与变换。因此,通过手动指定局部的点坐标位置,将(初次)配准较差的图像实现(二次)局部区域的精度微调。原创 2024-01-27 18:39:58 · 740 阅读 · 2 评论 -
(4)Elastix图像配准:3D图像
利用Elastix实现对3D图像的配准,深入研究如何应用Elastix工具实现对三维图像的准确注册,以满足复杂数据集的配准需求。原创 2024-01-25 13:52:12 · 1008 阅读 · 0 评论 -
(3)Elastix图像配准:2D图像
利用Elastix实现对2D图像的配准,探索如何利用该工具对二维图像进行精准注册,提升图像配准的实用性和效果。原创 2024-01-27 10:53:31 · 458 阅读 · 0 评论 -
(2)Elastix图像配准:参数文件(配准精度的关键)
(1)理解参数文件的每一个参数,才能实现图像的精确配准。(2)Elastix参数文件:由多个组件组成,每个组件包括多个参数。包括:移动图像、固定图像、金字塔、图像采样器、重采样器、插值器、重采样插值器、度量、优化器、变换、配准结果。原创 2024-01-25 09:15:43 · 900 阅读 · 0 评论 -
(1)Elastix图像配准:算法原理 + 环境配置 + 使用教程(详解)
Elastix:是一个基于ITK库开发用于医学图像配准的开源工具。它支持多种配准算法,包括刚性、相似性、仿射和非线性配准,适用于不同类型的图像配准任务。Elastix使用参数文件来配置配准算法和参数设置,用户可以根据需求自定义参数文件。它提供了命令行接口,也可以与Python等语言集成。原创 2023-09-29 07:25:33 · 2697 阅读 · 16 评论