一代测序（Sanger）结果ab1文件作图（基于Docker）

docker镜像拉取：

docker pull rochime/sanger_plot:1.0.0

运行镜像，映射端口，设置登录密码

docker run --rm -ti -e PASSWORD=yourpassword -p 8787:8787 rochime/sanger_plot:1.0.0

注意：把PASSWORD=yourpassword改成自定义的密码，如果不该，则密码为yourpassword。

打开http://localhost:8787/

输入账号为：rstudio，密码为：yourpassword

进入rstudio界面，此镜像使用版本为R version 4.3.0 (2023-04-21) -- "Already Tomorrow"

点击左上角，【File】-【Open Project】

进入sangerAlignment文件夹，选择sangerAlignment.Rproj打开，则进入改项目的renv环境

找到右下角的server.R或ui.R文件，单击打开任意一个文件如server.R

点击左上窗口的右上角Run App按钮，即打shiny app的Sanger测序作图界面

Sanger app作图界面

查看和调整峰图显示效果

点击Resutls部分可下载pdf报告

pdf主要内容：

配色风格参考：SnapGene软件的峰图查看功能

其他参考：

https://zhuanlan.zhihu.com/p/348085394