基因测序分析小经验

在送公司(如生工)测序后返回来的结果是失败,但仍旧有一个ab1文件,该文件就是 测序的原图
在这里插入图片描述
由于是割胶没有割好或是其他原因导致测序失败,把ab1文件转换成fas文件,再到NCBI进行blast,查看该序列是否包含目的基因。如若包含说明还可以继续该基因克隆,更改实验条件,直至克隆成功。大部分是不包含的,只有很小比列。假如不包含就可以放弃该引物,继续拼接其他的。
具体操作步骤如下:
1、从生工官网下载测序失败的ab1文件并用seqman打开
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双击蓝色
移动黑色框可以自由调整
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导出并生成seq文件
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复制该序列到NCBI上进行blast

完毕

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基因测序算法和基因比对算法在基因组研究中起到了不同的作用,它们有一些共同点,也有一些差别。 共同点是,两者都是用于分析基因组序列的算法。基因测序算法用于确定DNA或RNA序列的顺序,以获取完整的基因组信息。而基因比对算法则是将测得的基因组序列与参考基因组进行比较,以寻找相似性和差异性。 然而,两者也有一些差别。首先,基因测序算法更关注于获取基因组的原始序列信息,它可以使用多种方法,如Sanger测序、Illumina测序和第三代测序技术等。而基因比对算法则是将这些测得的序列与参考基因组进行比对,以寻找相同或相似的片段。 其次,基因测序算法通常是一个独立的步骤,它可以得到完整的基因组序列。而基因比对算法是在测序后的一个额外步骤,它将测序得到的序列与参考基因组进行比对,以确定它们之间的相似性和差异性。 最后,基因测序算法是一个相对较简单的过程,主要是通过测序仪器进行测序,并进行数据分析和处理。而基因比对算法则更复杂,涉及到序列比对和匹配的算法原理和计算方法的应用。 综上所述,基因测序算法和基因比对算法在基因组研究中有一些共同点,但也存在一些差别。前者用于获取基因组的原始序列信息,后者用于比对和分析这些序列与参考基因组的相似性和差异性。

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